More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0024 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
398 aa  787    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0027  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  87.6 
 
 
387 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444781  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  79.95 
 
 
405 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  79.43 
 
 
392 aa  609  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  79.17 
 
 
398 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2941  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  75.58 
 
 
391 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  67.64 
 
 
386 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  67.11 
 
 
386 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  66.05 
 
 
385 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  66.49 
 
 
385 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  65.88 
 
 
386 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  63.99 
 
 
404 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  64.32 
 
 
385 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  65.53 
 
 
385 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  63.93 
 
 
409 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  65.52 
 
 
390 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  64.19 
 
 
387 aa  481  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  63.13 
 
 
402 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  60.73 
 
 
401 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2537  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  67.9 
 
 
399 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  60.53 
 
 
389 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  59.69 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  60.73 
 
 
393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  58.95 
 
 
381 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  52.97 
 
 
392 aa  422  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0204  coproporphyrinogen III oxidase  56.99 
 
 
385 aa  415  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  57.03 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  58.08 
 
 
385 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  55.38 
 
 
385 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1224  coproporphyrinogen III oxidase  55.91 
 
 
385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2885  coproporphyrinogen III oxidase  55.38 
 
 
385 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  56.7 
 
 
397 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2870  coproporphyrinogen III oxidase  53.95 
 
 
384 aa  398  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0605644  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  55.12 
 
 
384 aa  388  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0013  coproporphyrinogen III oxidase  55.94 
 
 
394 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  59.53 
 
 
414 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  56.73 
 
 
393 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0258  coproporphyrinogen III oxidase  52.09 
 
 
381 aa  344  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  53.4 
 
 
382 aa  335  9e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.15 
 
 
387 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 
392 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.8 
 
 
393 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  43.5 
 
 
417 aa  267  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.41 
 
 
416 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.43 
 
 
394 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.87 
 
 
394 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.62 
 
 
396 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  42.63 
 
 
407 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  40.1 
 
 
390 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  44.88 
 
 
383 aa  256  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4323  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.26 
 
 
419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.86 
 
 
389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  39.68 
 
 
399 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 
419 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2448  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  43.54 
 
 
398 aa  249  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.403351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.3 
 
 
382 aa  249  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 
422 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2161  coproporphyrinogen III oxidase  40.92 
 
 
424 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0050137  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3351  coproporphyrinogen III oxidase  39.02 
 
 
378 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.315269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  39.57 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0856  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.08 
 
 
414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  37.82 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  42.01 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3343  coproporphyrinogen III oxidase  39.02 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0921  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.08 
 
 
414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698977 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.01 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0825  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 
376 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.330416  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3278  coproporphyrinogen III oxidase  39.02 
 
 
378 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.026335 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  39.04 
 
 
391 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0826  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 
376 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3267  coproporphyrinogen III oxidase  38.75 
 
 
378 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0143  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 
376 aa  244  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  39.25 
 
 
413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.38 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  40.47 
 
 
385 aa  243  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3447  coproporphyrinogen III oxidase  39.02 
 
 
378 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.286445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4258  coproporphyrinogen III oxidase  39.3 
 
 
378 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 
422 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  41.25 
 
 
380 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  39.57 
 
 
378 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  39.02 
 
 
378 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02748  hypothetical protein  39.02 
 
 
378 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.7 
 
 
387 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0755  coproporphyrinogen III oxidase  39.89 
 
 
379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.02 
 
 
378 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0759  coproporphyrinogen III oxidase  39.3 
 
 
378 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  38.81 
 
 
409 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3115  coproporphyrinogen III oxidase  39.3 
 
 
378 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  39.26 
 
 
379 aa  239  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 
382 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  40.2 
 
 
408 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  39.02 
 
 
380 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  38.96 
 
 
405 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.93 
 
 
385 aa  237  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3299  coproporphyrinogen III oxidase  38.75 
 
 
378 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.52 
 
 
381 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  38.96 
 
 
405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  38.96 
 
 
405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  38.96 
 
 
405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>