More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0258 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0258  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 381 aa  765    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  67.11 
 
 		 397 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  59.42 
 
 		 384 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  55.17 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  52.59 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.51 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0027  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.09 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444781  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.02 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  52.24 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  50.26 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  50.13 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  54.88 
 
 		 382 aa  365  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  50.39 
 
 		 401 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  49.61 
 
 		 385 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2870  coproporphyrinogen III oxidase  51.45 
 
 		 384 aa  362  8e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0605644  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  47.21 
 
 		 392 aa  362  9e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.66 
 
 		 385 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.4 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.09 
 
 		 398 aa  359  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0204  coproporphyrinogen III oxidase  50.92 
 
 		 385 aa  359  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  50.13 
 
 		 385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  50.4 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.66 
 
 		 405 aa  356  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  50.13 
 
 		 386 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  48.55 
 
 		 409 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2941  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.37 
 
 		 391 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0013  coproporphyrinogen III oxidase  52.76 
 
 		 394 aa  352  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  49.61 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.13 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  49.08 
 
 		 386 aa  347  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  48.81 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  48.81 
 
 		 385 aa  346  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2537  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.63 
 
 		 399 aa  345  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  48.81 
 
 		 385 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  47.77 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  48.81 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1224  coproporphyrinogen III oxidase  48.14 
 
 		 385 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2885  coproporphyrinogen III oxidase  47.61 
 
 		 385 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  47.09 
 
 		 385 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.92 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.21 
 
 		 389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  45.91 
 
 		 407 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  44.85 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  44.85 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  44.85 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  44.85 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  42.06 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  44.85 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  44.59 
 
 		 405 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  44.59 
 
 		 405 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.16 
 
 		 392 aa  286  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 409 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 409 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.53 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  42.59 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  43.27 
 
 		 405 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  42.06 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  42.06 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  42.06 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  43.46 
 
 		 413 aa  276  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  42.67 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  41.8 
 
 		 404 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  41.8 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  41.53 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2161  coproporphyrinogen III oxidase  42.78 
 
 		 424 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0050137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  43.4 
 
 		 422 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.82 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.16 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  43.43 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  41.05 
 
 		 422 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  43.1 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0479  coproporphyrinogen III oxidase  43.24 
 
 		 392 aa  255  9e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  40.94 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.97 
 
 		 394 aa  255  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  36.36 
 
 		 385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.2 
 
 		 396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1187  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.88 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.454386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 		 416 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  39.9 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.99 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.14 
 
 		 385 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  40.26 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.88 
 
 		 385 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2693  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.82 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  39.9 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  39.47 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  42.45 
 
 		 384 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.26 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1332  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.36 
 
 		 388 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000575717  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  39.21 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0040  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  38.89 
 
 		 384 aa  249  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02748  hypothetical protein  39.21 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3031  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.1 
 
 		 388 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472525  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.1 
 
 		 388 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000324324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4258  coproporphyrinogen III oxidase  39.21 
 
 		 378 aa  249  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  39.68 
 
 		 380 aa  248  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.21 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3115  coproporphyrinogen III oxidase  39.21 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>