More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0545 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0545  Coproporphyrinogen dehydrogenase  100 
 
 
404 aa  833    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal  0.412237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.38 
 
 
380 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  31.61 
 
 
378 aa  163  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07700  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.1 
 
 
368 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.04 
 
 
388 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1638  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.57 
 
 
349 aa  158  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0710  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.88 
 
 
375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.963013  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1468  oxygen-independent coproporphyrinogen-III oxidase  30.88 
 
 
375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.22 
 
 
375 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.75 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.06 
 
 
383 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.1 
 
 
374 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  36.49 
 
 
385 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  32.99 
 
 
376 aa  152  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  30.3 
 
 
404 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.27 
 
 
403 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.7 
 
 
380 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.1 
 
 
378 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0380  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.62 
 
 
379 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.182118  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5458  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.84 
 
 
406 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  34.15 
 
 
396 aa  149  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2687  coproporphyrinogen III oxidase  32.86 
 
 
398 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.992517  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.08 
 
 
381 aa  149  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0322  coproporphyrinogen III oxidase  32.62 
 
 
376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.49 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  31.13 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  29.89 
 
 
422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  32.03 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2161  coproporphyrinogen III oxidase  31.15 
 
 
424 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0050137  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.14 
 
 
389 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1716  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.54 
 
 
384 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.871197  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.29 
 
 
393 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  29.48 
 
 
404 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  29.75 
 
 
404 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.3 
 
 
394 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.56 
 
 
376 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  29.48 
 
 
404 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  32.75 
 
 
409 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.04 
 
 
381 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  30.27 
 
 
376 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1569  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.04 
 
 
411 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0883271  normal  0.0181268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  29 
 
 
404 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  28.98 
 
 
378 aa  143  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  29 
 
 
404 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  29 
 
 
404 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  30.14 
 
 
405 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  30.14 
 
 
405 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  30.14 
 
 
405 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  30.14 
 
 
405 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  29.82 
 
 
422 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  32.3 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  29.48 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.77 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  32.16 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  32.14 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.96 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.2 
 
 
414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  29.86 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.63 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1898  coproporphyrinogen III oxidase  33.91 
 
 
426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.41 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.41 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12840  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  32.51 
 
 
422 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  32.38 
 
 
379 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  29.86 
 
 
405 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.18 
 
 
371 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  29.86 
 
 
405 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  30.5 
 
 
385 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.5 
 
 
385 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  31.32 
 
 
443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  29.2 
 
 
409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1263  coproporphyrinogen III oxidase  32.51 
 
 
411 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0206083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  29.39 
 
 
401 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.17 
 
 
370 aa  140  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.797828  normal  0.0143577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.97 
 
 
387 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0703  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.8 
 
 
457 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.625393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  30.74 
 
 
379 aa  139  7.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10300  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.69 
 
 
372 aa  139  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  31.41 
 
 
376 aa  139  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2366  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.8 
 
 
410 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  29.68 
 
 
391 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.32 
 
 
392 aa  139  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.94 
 
 
381 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3838  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.09 
 
 
407 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584028  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.88 
 
 
448 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  31.39 
 
 
378 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0835  coproporphyrinogen III oxidase  33.1 
 
 
410 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  29.49 
 
 
413 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.01 
 
 
381 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  29.68 
 
 
386 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.56 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  29.58 
 
 
419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2785  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.12 
 
 
395 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419951  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  28.93 
 
 
404 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
377 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  30.52 
 
 
384 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  32.73 
 
 
387 aa  136  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  27.51 
 
 
377 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.07 
 
 
365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  31.39 
 
 
378 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>