More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2215 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
412 aa  797    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13360  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  71.26 
 
 
418 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186133  normal  0.0883125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  67.88 
 
 
409 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2199  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  65.85 
 
 
448 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1976  coproporphyrinogen III oxidase  67.64 
 
 
409 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000234846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1745  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  70.07 
 
 
405 aa  518  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  67.07 
 
 
401 aa  514  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1553  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  62.06 
 
 
423 aa  514  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  63.17 
 
 
403 aa  474  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3255  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  61.89 
 
 
403 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00582345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1898  coproporphyrinogen III oxidase  61.72 
 
 
426 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133769  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  62.62 
 
 
411 aa  458  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  59.08 
 
 
403 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1263  coproporphyrinogen III oxidase  60.34 
 
 
411 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0206083 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  62.83 
 
 
389 aa  448  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12400  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  57.01 
 
 
426 aa  436  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00807664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5458  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  56.55 
 
 
406 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3838  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  59.95 
 
 
407 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584028  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  58.84 
 
 
409 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7063  coproporphyrinogen III oxidase  58.21 
 
 
408 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405832  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1165  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  61.24 
 
 
415 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.77099  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3458  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  60.05 
 
 
407 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99275  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  57.66 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12840  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  60.52 
 
 
422 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1240  coproporphyrinogen III oxidase  56.31 
 
 
404 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000912695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0835  coproporphyrinogen III oxidase  58.37 
 
 
410 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1569  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  57.74 
 
 
411 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0883271  normal  0.0181268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0781  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  55.96 
 
 
400 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.41975  normal  0.123732 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0852  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.15 
 
 
436 aa  380  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2687  coproporphyrinogen III oxidase  56.22 
 
 
398 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.992517  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1636  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  56.07 
 
 
406 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.234243  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3165  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.52 
 
 
401 aa  364  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  54.92 
 
 
394 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0581  coproporphyrinogen III oxidase  55.62 
 
 
469 aa  358  9.999999999999999e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.496412  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12413  coproporphyrinogen III oxidase  54.52 
 
 
390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000120339  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3473  coproporphyrinogen III oxidase  56.19 
 
 
392 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0588926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3536  coproporphyrinogen III oxidase  56.19 
 
 
392 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15747  normal  0.866519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3486  coproporphyrinogen III oxidase  55.93 
 
 
392 aa  351  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2770  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.74 
 
 
391 aa  348  9e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  31.76 
 
 
374 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.63 
 
 
389 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  32.72 
 
 
379 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.12 
 
 
378 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  33.25 
 
 
379 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  32.72 
 
 
379 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  32.72 
 
 
378 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  32.72 
 
 
379 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  32.2 
 
 
378 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.24 
 
 
388 aa  226  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  32.46 
 
 
378 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  32.2 
 
 
378 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  36.6 
 
 
385 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  32.46 
 
 
379 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.74 
 
 
432 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  32.98 
 
 
378 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  32.47 
 
 
374 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  32.47 
 
 
374 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.02 
 
 
380 aa  223  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  32.2 
 
 
379 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  37.29 
 
 
384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.25 
 
 
375 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  33.51 
 
 
382 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.09 
 
 
371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.17 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.18 
 
 
378 aa  220  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1224  coproporphyrinogen III oxidase  39.6 
 
 
385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2885  coproporphyrinogen III oxidase  39.14 
 
 
385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 
409 aa  219  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.08 
 
 
377 aa  219  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.16 
 
 
381 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.97 
 
 
374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.12 
 
 
448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  37.63 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.5 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  37.87 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1001  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.63 
 
 
424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  35.93 
 
 
388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.06 
 
 
393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 
389 aa  213  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  35.96 
 
 
404 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.44 
 
 
384 aa  212  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  36.61 
 
 
385 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2113  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.91 
 
 
369 aa  212  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.512598  normal  0.05877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0013  coproporphyrinogen III oxidase  39 
 
 
394 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0204  coproporphyrinogen III oxidase  37.21 
 
 
385 aa  210  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5773  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.56 
 
 
374 aa  209  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  28.83 
 
 
376 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  36.42 
 
 
401 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 
387 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  31.43 
 
 
378 aa  208  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  36.32 
 
 
387 aa  207  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.76 
 
 
405 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.02 
 
 
385 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  27.3 
 
 
375 aa  207  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0241  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.59 
 
 
379 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  35.84 
 
 
385 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.76 
 
 
398 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.59 
 
 
406 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  35.05 
 
 
381 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.51 
 
 
381 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>