More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2063 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 384 aa  781    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  64.53 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0258  coproporphyrinogen III oxidase  59.42 
 
 		 381 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  55.12 
 
 		 398 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0027  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  55.67 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.72 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.72 
 
 		 405 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  56.02 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  53.89 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.72 
 
 		 389 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.23 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.76 
 
 		 402 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2941  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.85 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  51.19 
 
 		 401 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  51.96 
 
 		 381 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  51.57 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  51.45 
 
 		 385 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  50.66 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  50.91 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  51.17 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0204  coproporphyrinogen III oxidase  50.39 
 
 		 385 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2870  coproporphyrinogen III oxidase  51.18 
 
 		 384 aa  355  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0605644  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  51.19 
 
 		 386 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  51.98 
 
 		 386 aa  353  4e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  50.92 
 
 		 385 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  50.52 
 
 		 385 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  49.87 
 
 		 409 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  52.36 
 
 		 387 aa  348  7e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  51.84 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  50.4 
 
 		 404 aa  347  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  50.4 
 
 		 385 aa  347  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  49.34 
 
 		 385 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.19 
 
 		 385 aa  345  7e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  53.47 
 
 		 414 aa  345  8e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2537  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.65 
 
 		 399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0013  coproporphyrinogen III oxidase  49.87 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  46.82 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1224  coproporphyrinogen III oxidase  48.15 
 
 		 385 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2885  coproporphyrinogen III oxidase  48.15 
 
 		 385 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.2 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.37 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  43.12 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.06 
 
 		 392 aa  268  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.63 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  39.85 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  43.67 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  39.59 
 
 		 419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  41.85 
 
 		 417 aa  252  7e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  32.63 
 
 		 375 aa  252  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  41.28 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  38.82 
 
 		 422 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  41.28 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2161  coproporphyrinogen III oxidase  39.22 
 
 		 424 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0050137  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  41.28 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  41.28 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  41.28 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  41.28 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  43.2 
 
 		 409 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  40.99 
 
 		 405 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  40.99 
 
 		 405 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.18 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  38.12 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 		 409 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 404 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 404 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 404 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0479  coproporphyrinogen III oxidase  44.54 
 
 		 392 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.02 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  40.94 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3651  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.82 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  40.32 
 
 		 408 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.56 
 
 		 416 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  39.71 
 
 		 404 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4323  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.66 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  40.24 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  38.82 
 
 		 422 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  39.47 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.21 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  41.19 
 
 		 385 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.19 
 
 		 385 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0124  coproporphyrinogen III oxidase  36.92 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  36.25 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 		 379 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  37.34 
 
 		 391 aa  233  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  38.64 
 
 		 379 aa  232  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.68 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  38.44 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.42 
 
 		 385 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  35.42 
 
 		 385 aa  230  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.15 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.17 
 
 		 381 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1187  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.42 
 
 		 385 aa  229  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.454386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  37.4 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0755  coproporphyrinogen III oxidase  37.96 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0971  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.03 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0040  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  40.95 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>