More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0173 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0173  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
387 aa  771    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3011  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.93 
 
 
389 aa  347  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  48.56 
 
 
381 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  47.11 
 
 
393 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  47.51 
 
 
401 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  47.68 
 
 
387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.94 
 
 
385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3460  coproporphyrinogen III oxidase  49.87 
 
 
387 aa  323  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  46.72 
 
 
400 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2870  coproporphyrinogen III oxidase  47.89 
 
 
384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0605644  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  53.64 
 
 
414 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  44.5 
 
 
392 aa  317  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  46.11 
 
 
385 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  46.56 
 
 
385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  48.2 
 
 
384 aa  308  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  44.97 
 
 
409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0027  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2537  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.57 
 
 
399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  49.1 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  45.77 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.55 
 
 
389 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1224  coproporphyrinogen III oxidase  46.56 
 
 
385 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  45.24 
 
 
404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  45.24 
 
 
385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2885  coproporphyrinogen III oxidase  46.3 
 
 
385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  48.04 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0258  coproporphyrinogen III oxidase  50.92 
 
 
381 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.15 
 
 
398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0204  coproporphyrinogen III oxidase  47.31 
 
 
385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  46.56 
 
 
385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.05 
 
 
402 aa  302  6.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  46.03 
 
 
390 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0323  coproporphyrinogen III oxidase  45.53 
 
 
386 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.03 
 
 
398 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.65 
 
 
392 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2941  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.62 
 
 
391 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.77 
 
 
405 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0013  coproporphyrinogen III oxidase  47.09 
 
 
394 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1693  coproporphyrinogen III oxidase  48.44 
 
 
382 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616989  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  44.18 
 
 
386 aa  287  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  44.18 
 
 
386 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  38.95 
 
 
413 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.43 
 
 
394 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.69 
 
 
396 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.73 
 
 
387 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  37.01 
 
 
399 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  36.29 
 
 
409 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 
404 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  38.95 
 
 
419 aa  236  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 
404 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 
404 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 
404 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  37.43 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.6 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 
390 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  36.65 
 
 
404 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  36.65 
 
 
404 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  36.88 
 
 
422 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  38.28 
 
 
405 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  38.28 
 
 
405 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  38.28 
 
 
405 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  38.28 
 
 
405 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.58 
 
 
393 aa  229  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  35.57 
 
 
408 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  38.02 
 
 
405 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 
405 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  40.16 
 
 
407 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 
405 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  34.55 
 
 
404 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.94 
 
 
390 aa  226  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.03 
 
 
382 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  37.83 
 
 
405 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  45.65 
 
 
408 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  37.89 
 
 
385 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.7 
 
 
381 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2161  coproporphyrinogen III oxidase  37.83 
 
 
424 aa  222  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0050137  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  37.04 
 
 
422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  33.25 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.21 
 
 
394 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.15 
 
 
385 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4323  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 
419 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1187  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.15 
 
 
385 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.454386  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.92 
 
 
381 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.91 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.3 
 
 
410 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.07 
 
 
385 aa  216  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  37.07 
 
 
385 aa  216  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.62 
 
 
385 aa  216  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.3 
 
 
414 aa  215  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1226  coproporphyrinogen dehydrogenase  34.87 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000226864  normal  0.222132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1263  coproporphyrinogen III oxidase  37.86 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0206083 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0847  coproporphyrinogen III oxidase  44 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0760  coproporphyrinogen III oxidase  38.58 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  37.43 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  35.92 
 
 
391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  35.7 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 
386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35 
 
 
374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>