More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5773 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5773  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
374 aa  784    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  58.02 
 
 
374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0352  hypothetical protein  49.06 
 
 
375 aa  383  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.33 
 
 
374 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  46.9 
 
 
376 aa  364  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0380  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.63 
 
 
379 aa  360  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.182118  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0165  coproporphyrinogen oxidase (coproporphyrinogen III oxidase)  44.59 
 
 
373 aa  345  6e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.763893  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1376  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.41 
 
 
384 aa  344  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0078  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.4 
 
 
383 aa  331  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  42.63 
 
 
376 aa  297  2e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.75 
 
 
393 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.42 
 
 
383 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  35.83 
 
 
379 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  36.1 
 
 
378 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  36.1 
 
 
379 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  36.1 
 
 
379 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  36.1 
 
 
379 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  37.5 
 
 
385 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  35.83 
 
 
378 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.61 
 
 
360 aa  246  3e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  35.56 
 
 
379 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  35.83 
 
 
378 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  35.83 
 
 
378 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.23 
 
 
385 aa  242  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  35.29 
 
 
379 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2375  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.24 
 
 
374 aa  238  9e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.950801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.04 
 
 
383 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.04 
 
 
371 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  36.24 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  32.71 
 
 
376 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  37.87 
 
 
379 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.34 
 
 
448 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0332  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.54 
 
 
374 aa  230  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2018  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.26 
 
 
374 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0118998  normal  0.0725474 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.42 
 
 
378 aa  226  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.4 
 
 
381 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  39.63 
 
 
393 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.51 
 
 
380 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  33.61 
 
 
380 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.38 
 
 
484 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  34.46 
 
 
401 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  31.9 
 
 
378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.32 
 
 
378 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.88 
 
 
403 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.11 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.7 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2244  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.62 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.37 
 
 
578 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  33.78 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0455  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.29 
 
 
391 aa  220  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  36.48 
 
 
385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.1 
 
 
432 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  34.75 
 
 
397 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1976  coproporphyrinogen III oxidase  34.63 
 
 
409 aa  219  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000234846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0781  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  35.54 
 
 
400 aa  219  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.41975  normal  0.123732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.23 
 
 
384 aa  219  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2187  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.93 
 
 
390 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  35.09 
 
 
403 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.56 
 
 
412 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.75 
 
 
381 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  34.32 
 
 
388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  32.27 
 
 
377 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.33 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2770  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.68 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.51 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1516  coproporphyrinogen III oxidase  34.99 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493092  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1806  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.12 
 
 
374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1553  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34 
 
 
423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0222  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.66 
 
 
371 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0397  coproporphyrinogen III oxidase  34.91 
 
 
385 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  31.73 
 
 
377 aa  212  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.27 
 
 
389 aa  212  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7063  coproporphyrinogen III oxidase  35.77 
 
 
408 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405832  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3473  coproporphyrinogen III oxidase  34.39 
 
 
392 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0588926  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  35.26 
 
 
409 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3536  coproporphyrinogen III oxidase  34.39 
 
 
392 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15747  normal  0.866519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.02 
 
 
381 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3486  coproporphyrinogen III oxidase  34.39 
 
 
392 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  34.03 
 
 
389 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.05 
 
 
378 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.92 
 
 
382 aa  210  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.9 
 
 
385 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.29 
 
 
398 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  33.07 
 
 
409 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1745  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 
405 aa  208  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  34.32 
 
 
378 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0423  coproporphyrinogen III oxidase  34.03 
 
 
390 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  31.42 
 
 
374 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2223  coproporphyrinogen III oxidase  33.33 
 
 
396 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  33.68 
 
 
387 aa  206  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  35 
 
 
385 aa  205  9e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.24 
 
 
392 aa  205  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2870  coproporphyrinogen III oxidase  32.98 
 
 
384 aa  205  9e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0605644  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  35 
 
 
404 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  32.81 
 
 
384 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  30.91 
 
 
379 aa  205  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  34.29 
 
 
408 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.77 
 
 
389 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  37.2 
 
 
393 aa  203  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>