More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0110 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  100 
 
 
393 aa  805    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.95 
 
 
381 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  47.19 
 
 
383 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.49 
 
 
380 aa  285  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.84 
 
 
378 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  43.01 
 
 
385 aa  279  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.06 
 
 
393 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.63 
 
 
381 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  41.16 
 
 
388 aa  276  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.78 
 
 
381 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
381 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  40.94 
 
 
376 aa  258  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.56 
 
 
432 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.34 
 
 
385 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 
388 aa  256  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  40.48 
 
 
378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  38.97 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39 
 
 
378 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.58 
 
 
375 aa  249  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.95 
 
 
378 aa  245  9e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.06 
 
 
382 aa  242  7e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.02 
 
 
387 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 
383 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.65 
 
 
390 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  35.81 
 
 
375 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  41.62 
 
 
422 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.36 
 
 
384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.51 
 
 
389 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  42.94 
 
 
404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1516  coproporphyrinogen III oxidase  38.86 
 
 
405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493092  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.62 
 
 
381 aa  233  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  47.48 
 
 
408 aa  232  8.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2601  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 
414 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2314  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.93 
 
 
408 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256017  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  32.28 
 
 
377 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  48.68 
 
 
385 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.13 
 
 
484 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.37 
 
 
448 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 
404 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 
404 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.4 
 
 
378 aa  230  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 
404 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3505  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 
414 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 
404 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.94 
 
 
374 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  41.3 
 
 
404 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  39.9 
 
 
386 aa  229  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 
404 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1121  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.13 
 
 
378 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.002803  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0040  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  41.69 
 
 
384 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  32.55 
 
 
377 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  34.13 
 
 
378 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  41.34 
 
 
391 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3079  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  42.03 
 
 
380 aa  226  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.862444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41 
 
 
371 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  37.14 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  38.99 
 
 
407 aa  226  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  42.61 
 
 
414 aa  225  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0380  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.29 
 
 
379 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.182118  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.27 
 
 
389 aa  225  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  41.46 
 
 
396 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 
409 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  38.44 
 
 
386 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  37.37 
 
 
385 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  37.77 
 
 
379 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 
405 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 
405 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 
405 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
384 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 
405 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 
405 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1187  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.71 
 
 
385 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.454386  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 
374 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0352  hypothetical protein  34.82 
 
 
375 aa  224  3e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2276  hypothetical protein  44.53 
 
 
375 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  41.55 
 
 
405 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.3 
 
 
578 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  41.55 
 
 
405 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  39.89 
 
 
401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.33 
 
 
385 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  37.44 
 
 
385 aa  223  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  41.55 
 
 
405 aa  222  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  39.49 
 
 
399 aa  222  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  33.87 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  40.78 
 
 
422 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0847  coproporphyrinogen III oxidase  47.94 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.44 
 
 
380 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  42.02 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2303  hypothetical protein  43.8 
 
 
375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.07 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.36 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  36.78 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2161  coproporphyrinogen III oxidase  41.55 
 
 
424 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0050137  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0760  coproporphyrinogen III oxidase  47.57 
 
 
383 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2223  coproporphyrinogen III oxidase  36.18 
 
 
396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2448  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  40.93 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.403351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  39.01 
 
 
404 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2472  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.31 
 
 
400 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  41.26 
 
 
409 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>