More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0876 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
457 aa  937    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.38 
 
 
462 aa  501  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  48.9 
 
 
460 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.13 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.04 
 
 
465 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  48.58 
 
 
472 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.04 
 
 
465 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 
465 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 
460 aa  447  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  46.36 
 
 
451 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  45.7 
 
 
451 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  45.7 
 
 
451 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  46.37 
 
 
453 aa  411  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  46.04 
 
 
451 aa  411  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  45.41 
 
 
489 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  44.1 
 
 
458 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  41.7 
 
 
465 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  44.35 
 
 
457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  46.37 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  42.23 
 
 
465 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  41.74 
 
 
460 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  45.05 
 
 
455 aa  402  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  46.36 
 
 
453 aa  404  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  45.59 
 
 
452 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.73 
 
 
464 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  43.02 
 
 
458 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 
455 aa  398  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  42.01 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.23 
 
 
457 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4514  coproporphyrinogen III oxidase  43.83 
 
 
457 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130289  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  43.39 
 
 
457 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 
460 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 
463 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  41.43 
 
 
462 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  42.79 
 
 
461 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  43.6 
 
 
500 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.23 
 
 
471 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4224  coproporphyrinogen III oxidase  43.61 
 
 
457 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.365232  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 
478 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  42.57 
 
 
463 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  42.35 
 
 
470 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  43.02 
 
 
458 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  41.76 
 
 
460 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 
457 aa  393  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  42.79 
 
 
464 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  39.87 
 
 
483 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  42.79 
 
 
464 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4161  coproporphyrinogen III oxidase  42.6 
 
 
457 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0332782  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  39.87 
 
 
481 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  42.79 
 
 
464 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  41.24 
 
 
463 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  39.87 
 
 
481 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  42.79 
 
 
464 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  42.79 
 
 
464 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  43.61 
 
 
485 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  42.57 
 
 
464 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 
481 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  42.57 
 
 
458 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.81 
 
 
458 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  43.39 
 
 
457 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 
457 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  42.57 
 
 
480 aa  395  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  43.39 
 
 
457 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  43.39 
 
 
457 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  39.87 
 
 
483 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  43.39 
 
 
457 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  42.79 
 
 
464 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  42.79 
 
 
464 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
463 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 
457 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 
457 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 
457 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  41.9 
 
 
460 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  39.65 
 
 
483 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  43.81 
 
 
456 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  39.87 
 
 
483 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 
457 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  43.17 
 
 
457 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 
457 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 
457 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  40.31 
 
 
460 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  42.38 
 
 
482 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  39.87 
 
 
483 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 
457 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  41.02 
 
 
463 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 
457 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  44.99 
 
 
446 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 
463 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  41.02 
 
 
463 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 
457 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
461 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  40.53 
 
 
469 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  40.18 
 
 
468 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  40.31 
 
 
460 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  43.56 
 
 
446 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 
456 aa  388  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  41.68 
 
 
460 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  41.14 
 
 
465 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  41.94 
 
 
484 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  44.32 
 
 
446 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>