More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0606 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  65.43 
 
 		 457 aa  639    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 455 aa  950    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  63.3 
 
 		 453 aa  625  1e-178  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  62.86 
 
 		 452 aa  618  1e-176  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  63.52 
 
 		 451 aa  617  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  63.3 
 
 		 451 aa  617  1e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  63.08 
 
 		 451 aa  616  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  62.2 
 
 		 451 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  59.78 
 
 		 453 aa  597  1e-169  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  59.56 
 
 		 453 aa  595  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.33 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.24 
 
 		 465 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  45.27 
 
 		 460 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  47.25 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  45.23 
 
 		 482 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.04 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.41 
 
 		 478 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  45.47 
 
 		 463 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  46.36 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  46.36 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.36 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.27 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.27 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  46.68 
 
 		 472 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  46.36 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  44.57 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  46.36 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 		 463 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  46.36 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  46.36 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  46.36 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.79 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  44.57 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  45.23 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.44 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  44.35 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  44.35 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  45.53 
 
 		 468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  46.59 
 
 		 480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.58 
 
 		 471 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  45.92 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  46.53 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  45.05 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  46.31 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  45.47 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  46.31 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  45.83 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  46.31 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  44.37 
 
 		 489 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  44.24 
 
 		 494 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 461 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  45.93 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  46.31 
 
 		 446 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  46.53 
 
 		 446 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  46.31 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 		 469 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0233  coproporphyrinogen III oxidase  46.15 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.891625  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.89 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  45.71 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  45.92 
 
 		 458 aa  398  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  41.85 
 
 		 481 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  41.63 
 
 		 483 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  41.63 
 
 		 481 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  45.7 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  45.43 
 
 		 460 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  41.85 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  41.63 
 
 		 481 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  43.51 
 
 		 494 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.74 
 
 		 460 aa  398  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.05 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  41.63 
 
 		 483 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  41.85 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  41.63 
 
 		 483 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  46.31 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  46.09 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  46.09 
 
 		 446 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.16 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0096  coproporphyrinogen III oxidase  45.86 
 
 		 446 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  45.03 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0090  coproporphyrinogen III oxidase  45.41 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142789 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  45.86 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  44.32 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.45 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  43.38 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  43.74 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  42.26 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  42.06 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  43.46 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4224  coproporphyrinogen III oxidase  44.49 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.365232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  43.74 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  43.46 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  44.81 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  43.46 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  43.74 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  43.84 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>