More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0042 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  82.96 
 
 		 446 aa  808    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  85.2 
 
 		 458 aa  825    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  84.75 
 
 		 446 aa  818    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  84.75 
 
 		 446 aa  818    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0053  coproporphyrinogen III oxidase  85.65 
 
 		 446 aa  825    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59946  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  84.75 
 
 		 446 aa  818    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0096  coproporphyrinogen III oxidase  87.22 
 
 		 446 aa  837    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0090  coproporphyrinogen III oxidase  85.43 
 
 		 446 aa  823    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142789 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  82.51 
 
 		 446 aa  797    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  84.53 
 
 		 446 aa  819    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  85.2 
 
 		 446 aa  822    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  85.43 
 
 		 446 aa  823    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 446 aa  931    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  85.43 
 
 		 446 aa  824    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  84.75 
 
 		 446 aa  818    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  82.74 
 
 		 446 aa  798    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  65.7 
 
 		 457 aa  624  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4161  coproporphyrinogen III oxidase  64.57 
 
 		 457 aa  621  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0332782  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  65.02 
 
 		 455 aa  621  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  64.57 
 
 		 457 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  64.57 
 
 		 457 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  64.57 
 
 		 457 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  64.57 
 
 		 457 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  64.57 
 
 		 457 aa  617  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  64.57 
 
 		 457 aa  619  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  64.57 
 
 		 457 aa  619  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  64.57 
 
 		 457 aa  619  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  64.57 
 
 		 457 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  64.35 
 
 		 457 aa  615  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  64.8 
 
 		 463 aa  615  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  63.9 
 
 		 457 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  63.9 
 
 		 457 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  63.68 
 
 		 485 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  63.9 
 
 		 457 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  64.57 
 
 		 463 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  63.9 
 
 		 457 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  63.9 
 
 		 480 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  63.68 
 
 		 457 aa  608  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0233  coproporphyrinogen III oxidase  64.13 
 
 		 457 aa  604  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.891625  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4514  coproporphyrinogen III oxidase  63.23 
 
 		 457 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130289  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4224  coproporphyrinogen III oxidase  63 
 
 		 457 aa  599  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.365232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  63.23 
 
 		 457 aa  600  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  62.78 
 
 		 455 aa  600  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  63.23 
 
 		 457 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  63.23 
 
 		 457 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  58.07 
 
 		 456 aa  548  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  51.88 
 
 		 460 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  50.78 
 
 		 465 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  51.66 
 
 		 460 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  51.22 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  50.11 
 
 		 460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  51.67 
 
 		 458 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.55 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  51 
 
 		 460 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  51 
 
 		 460 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  51 
 
 		 460 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  51.22 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  50.55 
 
 		 460 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  50.33 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  46.58 
 
 		 460 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  48.78 
 
 		 461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  48.91 
 
 		 484 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  48.78 
 
 		 473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  45.92 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2449  coproporphyrinogen III oxidase  50.75 
 
 		 514 aa  441  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1104  coproporphyrinogen III oxidase  49.55 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.45 
 
 		 461 aa  438  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  46.92 
 
 		 471 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  47.45 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  45.7 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  47.67 
 
 		 482 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.48 
 
 		 464 aa  438  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.14 
 
 		 478 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  47.45 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  47.23 
 
 		 463 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  44.81 
 
 		 468 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  47.23 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  47.23 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  44.59 
 
 		 460 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  47.01 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2126  coproporphyrinogen III oxidase  49.46 
 
 		 514 aa  431  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.94449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  44.89 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  45.11 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  46.56 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2361  coproporphyrinogen III oxidase  47.28 
 
 		 522 aa  428  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.12 
 
 		 463 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.34 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  47.01 
 
 		 461 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  45.05 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  47.67 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.12 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  47.14 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.12 
 
 		 463 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.59 
 
 		 462 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.8 
 
 		 465 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.8 
 
 		 465 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  45.9 
 
 		 464 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.78 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>