More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0660 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 359 aa  718    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  51.39 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  49.69 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  45.73 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  45.45 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  46.13 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  40.82 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  36.59 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  42.39 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  33.76 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  36.99 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  36.05 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  33.96 
 
 		 346 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  34.41 
 
 		 374 aa  195  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  38.11 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  37.74 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  33.87 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  37.32 
 
 		 317 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  35.58 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  36.76 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  38.38 
 
 		 314 aa  169  9e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  28.66 
 
 		 401 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  30.5 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  28.01 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.65 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  34.53 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  29.72 
 
 		 541 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.7 
 
 		 473 aa  91.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  28.92 
 
 		 541 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  33.59 
 
 		 563 aa  90.5  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  29.83 
 
 		 530 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  28.34 
 
 		 541 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.19 
 
 		 514 aa  89.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  32.04 
 
 		 512 aa  89.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  28.83 
 
 		 541 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  28.65 
 
 		 526 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  31.79 
 
 		 520 aa  83.2  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 483 aa  82.8  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  27.87 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  23.15 
 
 		 527 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  31.54 
 
 		 548 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.38 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  28.39 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  28.81 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  29.38 
 
 		 547 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  28.63 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  25.37 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  21.64 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  27.78 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  27.35 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  25.84 
 
 		 576 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.32 
 
 		 553 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  27.01 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  28.34 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  25.75 
 
 		 556 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  21.93 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  25.71 
 
 		 617 aa  68.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  26.73 
 
 		 666 aa  67.8  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  24.36 
 
 		 307 aa  67  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2881  coproporphyrinogen III oxidase  25.11 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.969668  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  25.56 
 
 		 554 aa  66.6  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  23.26 
 
 		 585 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  22.01 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  20.57 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  20.57 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  25.87 
 
 		 555 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  25.21 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  21.05 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  20.57 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  27.37 
 
 		 598 aa  63.5  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  20.57 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11990  radical SAM protein, TIGR01212 family  28.09 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000013437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  24.46 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  20.57 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  20.57 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  20.1 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  20.57 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  20.57 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  20.57 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  20.57 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  20.57 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  22.4 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  22.98 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  27.41 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0370  putative radical SAM protein  27.85 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  21.8 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  22.9 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  22.43 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  24.54 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  24.69 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  23.36 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0890  hypothetical protein  25.68 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.896383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.78 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  26.38 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  27.98 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>