164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2046 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  65.26 
 
 
522 aa  652    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  66 
 
 
520 aa  684    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  100 
 
 
530 aa  1084    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  69.74 
 
 
526 aa  694    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  68.54 
 
 
526 aa  691    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  53.38 
 
 
547 aa  555  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  50.1 
 
 
548 aa  528  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  55.21 
 
 
512 aa  526  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  52.52 
 
 
576 aa  511  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  50.97 
 
 
556 aa  511  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  50.78 
 
 
553 aa  506  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  51.36 
 
 
554 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  49.53 
 
 
585 aa  482  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  44.34 
 
 
541 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  44.53 
 
 
541 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  44.53 
 
 
541 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  47.31 
 
 
514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  44.44 
 
 
563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  44.34 
 
 
541 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  45.88 
 
 
473 aa  427  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  46.19 
 
 
510 aa  415  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  39.61 
 
 
527 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  45.59 
 
 
477 aa  384  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  42.23 
 
 
544 aa  380  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  45.49 
 
 
469 aa  377  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  44.61 
 
 
483 aa  378  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  40.4 
 
 
558 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  43.4 
 
 
555 aa  375  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  40.35 
 
 
574 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  39.39 
 
 
557 aa  360  4e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  44.59 
 
 
459 aa  356  6.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  44.59 
 
 
459 aa  353  4e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  44.49 
 
 
459 aa  345  1e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  31.93 
 
 
598 aa  287  2.9999999999999996e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  34.01 
 
 
617 aa  204  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  31.13 
 
 
666 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  36.51 
 
 
345 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  38.07 
 
 
342 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  33.99 
 
 
351 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  33.19 
 
 
346 aa  99.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  33.19 
 
 
343 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  33.15 
 
 
338 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  40.8 
 
 
341 aa  95.1  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 
342 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 
354 aa  91.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 
359 aa  90.5  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 
357 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  27.13 
 
 
362 aa  88.6  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 
357 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 
336 aa  87  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.82 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  32.45 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  35.2 
 
 
344 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  32.31 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  31.94 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 
359 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  29.59 
 
 
334 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 
317 aa  65.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  29.94 
 
 
332 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  29.65 
 
 
332 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  29.41 
 
 
332 aa  63.9  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  25.91 
 
 
368 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0754  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 
319 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  29.48 
 
 
341 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  25.5 
 
 
304 aa  61.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
340 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  28.66 
 
 
306 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  23.98 
 
 
325 aa  58.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  25.61 
 
 
328 aa  57.4  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.47 
 
 
372 aa  57.4  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  28.57 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  23.71 
 
 
318 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  21.35 
 
 
319 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  31.51 
 
 
351 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  24.49 
 
 
314 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  24.1 
 
 
319 aa  54.3  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  24.53 
 
 
311 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  24.53 
 
 
311 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  24.56 
 
 
317 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1087  radical SAM family protein  27.75 
 
 
311 aa  52.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.447962 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.64 
 
 
484 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  28.72 
 
 
334 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  24.27 
 
 
319 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  24.27 
 
 
319 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  24.27 
 
 
319 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  29.17 
 
 
347 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  27.64 
 
 
401 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  27.5 
 
 
311 aa  50.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  25.13 
 
 
318 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  31.47 
 
 
309 aa  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  24.27 
 
 
319 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  24.27 
 
 
319 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  24.27 
 
 
319 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  26 
 
 
384 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>