More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3151 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 351 aa  711    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  56.36 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  57.36 
 
 		 342 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  55.07 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  53.62 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  42.61 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  44.04 
 
 		 362 aa  262  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  40.72 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  40.25 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  41.59 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  41.54 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  39.18 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  39.56 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  41.92 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  38.54 
 
 		 357 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  36.99 
 
 		 359 aa  209  8e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 		 357 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  36.13 
 
 		 314 aa  189  9e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.91 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  37.6 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  38.99 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  36.72 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  33.96 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  39.14 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 317 aa  149  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  36.42 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  32.05 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  33.33 
 
 		 459 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.34 
 
 		 514 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  27.84 
 
 		 563 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  31.17 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  31.23 
 
 		 510 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  33.91 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  30.51 
 
 		 459 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  30.8 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  29.84 
 
 		 526 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  38.27 
 
 		 512 aa  106  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  26.71 
 
 		 527 aa  103  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  31.12 
 
 		 526 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  33.99 
 
 		 530 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.9 
 
 		 473 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  27.67 
 
 		 541 aa  99.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 477 aa  99.4  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  28.68 
 
 		 547 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  27.67 
 
 		 541 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  25.88 
 
 		 541 aa  97.1  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  27.27 
 
 		 541 aa  97.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  31.93 
 
 		 585 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  34.1 
 
 		 520 aa  94.4  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  37.4 
 
 		 548 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.97 
 
 		 556 aa  93.2  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  30.99 
 
 		 666 aa  90.9  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  30.81 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  23.36 
 
 		 553 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  28.7 
 
 		 332 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  28.7 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  26.28 
 
 		 554 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  28.69 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  24.28 
 
 		 576 aa  86.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  27.95 
 
 		 332 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  28.43 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  26.67 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  30.2 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.44 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  27.32 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0455  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.91 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  28.57 
 
 		 574 aa  79.7  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  25.23 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  25.23 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  25.23 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  25.23 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  25.23 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  29.41 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.27 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  25.45 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.13 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  26.07 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  35.83 
 
 		 555 aa  76.6  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1226  coproporphyrinogen dehydrogenase  29.15 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000226864  normal  0.222132 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.15 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  28.7 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  31.97 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1516  coproporphyrinogen III oxidase  28.99 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2687  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.21 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000667437  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07700  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.19 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  25.93 
 
 		 617 aa  75.9  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  27.06 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3606  coproporphyrinogen III oxidase  27.72 
 
 		 518 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  27.35 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  25.13 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1194  coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0134211 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  27.31 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  24.32 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  23.87 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  23.87 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  28.7 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.54 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  23.87 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>