215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1989 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  67.53 
 
 
547 aa  797    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  100 
 
 
548 aa  1138    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  53.31 
 
 
576 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  53.33 
 
 
512 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  51.83 
 
 
556 aa  574  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  51.27 
 
 
553 aa  569  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  50.45 
 
 
554 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  49.65 
 
 
585 aa  544  1e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  50.47 
 
 
522 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  50.1 
 
 
530 aa  528  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  49.44 
 
 
526 aa  521  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  49.35 
 
 
520 aa  521  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  50 
 
 
541 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  48.6 
 
 
526 aa  499  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  49.41 
 
 
541 aa  498  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  49.21 
 
 
541 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  48.34 
 
 
563 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  47.35 
 
 
514 aa  491  1e-137  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  45.26 
 
 
541 aa  474  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  47.93 
 
 
473 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  42.12 
 
 
527 aa  437  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  46.57 
 
 
510 aa  422  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  41.03 
 
 
544 aa  412  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  42.78 
 
 
558 aa  406  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  40.6 
 
 
555 aa  395  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  45.17 
 
 
483 aa  394  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  39.79 
 
 
574 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  43.16 
 
 
477 aa  382  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  45.11 
 
 
469 aa  377  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  41.38 
 
 
557 aa  374  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  42.09 
 
 
459 aa  348  1e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  43 
 
 
459 aa  345  8.999999999999999e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  42.51 
 
 
459 aa  343  4e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  31.49 
 
 
617 aa  262  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  31.59 
 
 
666 aa  247  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  30.4 
 
 
598 aa  246  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  41.13 
 
 
345 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  31.67 
 
 
341 aa  99  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  34.64 
 
 
342 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  37.4 
 
 
351 aa  93.6  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  36.88 
 
 
338 aa  92  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 
343 aa  90.1  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 
336 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  33.12 
 
 
317 aa  89  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  35.88 
 
 
342 aa  88.6  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  31.11 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  38.02 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 
359 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 
354 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.17 
 
 
309 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  33.83 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  32.84 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 
314 aa  77  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  27.05 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 
401 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  23.19 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  32.7 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  31.41 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  28 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  26.53 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  30.77 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  31.45 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  24.4 
 
 
313 aa  66.6  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  30.19 
 
 
304 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  27.46 
 
 
313 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  26.57 
 
 
304 aa  66.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  33.12 
 
 
334 aa  65.1  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 
357 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  26.04 
 
 
318 aa  64.7  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  29.27 
 
 
312 aa  64.3  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  29.37 
 
 
368 aa  63.9  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  25.77 
 
 
341 aa  63.9  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  27.38 
 
 
307 aa  63.9  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  27.44 
 
 
330 aa  63.9  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11990  radical SAM protein, TIGR01212 family  26.4 
 
 
318 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000013437  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
357 aa  63.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  27.44 
 
 
309 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  27.38 
 
 
329 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  24.76 
 
 
318 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  32.06 
 
 
347 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 
564 aa  62.4  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25 
 
 
372 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  25.32 
 
 
319 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  25 
 
 
312 aa  62  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  27.59 
 
 
317 aa  60.8  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  30.72 
 
 
372 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1611  radical SAM superfamily protein  26.9 
 
 
314 aa  60.5  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.586759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  26.15 
 
 
325 aa  60.5  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  26.75 
 
 
318 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 
340 aa  60.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  25.32 
 
 
319 aa  60.1  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  23.86 
 
 
309 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  25.35 
 
 
316 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  27.38 
 
 
327 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  26.19 
 
 
309 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>