More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1179 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 314 aa  635    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  51.63 
 
 		 317 aa  317  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  43.32 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  42.35 
 
 		 317 aa  255  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  39.56 
 
 		 341 aa  215  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  39.57 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  37.97 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  38.97 
 
 		 354 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  39.42 
 
 		 336 aa  199  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 342 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  34.67 
 
 		 343 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  36.13 
 
 		 351 aa  189  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  36.86 
 
 		 362 aa  188  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  39.43 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  40.14 
 
 		 357 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  34.07 
 
 		 342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  35.64 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  32.73 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  36.4 
 
 		 359 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  33.46 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  38.38 
 
 		 359 aa  169  7e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  28.62 
 
 		 354 aa  142  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.41 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  28.44 
 
 		 514 aa  98.6  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  32.87 
 
 		 512 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  33.33 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  36.09 
 
 		 473 aa  94.4  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1418  conserved hypothetical radical SAM protein  42.19 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  31.79 
 
 		 563 aa  90.9  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  31.36 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 469 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  28.63 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  29.06 
 
 		 541 aa  89.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  31.13 
 
 		 332 aa  89.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  29.58 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  30.27 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  29.58 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  26.19 
 
 		 527 aa  87  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  31.58 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  27.94 
 
 		 541 aa  86.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  26.03 
 
 		 564 aa  86.3  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  30.46 
 
 		 666 aa  85.9  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  32.86 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  27.5 
 
 		 557 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  30.19 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  26.71 
 
 		 558 aa  84  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  24.04 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  25.56 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  25.96 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  23.79 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  24.52 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  24.04 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  26.56 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  25.48 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  30.99 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  32.09 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  25.24 
 
 		 555 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  30.22 
 
 		 574 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  28.64 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  26.32 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  28.89 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  27.08 
 
 		 530 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  26.07 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  27.39 
 
 		 544 aa  79.7  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  29.63 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  30.03 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  25.11 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0370  putative radical SAM protein  28.89 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  25.78 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  28.57 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4119  putative radical SAM protein  32.09 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  24.67 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  25.22 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  32.87 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  25.38 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  25.65 
 
 		 526 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  26 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  28.68 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  27.65 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0890  hypothetical protein  27.23 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.896383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  25 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  29.86 
 
 		 547 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  25.19 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  24.35 
 
 		 459 aa  75.9  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  28.45 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  24.6 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  28.68 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  24.04 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  24.35 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  24.04 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  24.04 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  26.92 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  24.04 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>