More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0579 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  100 
 
 
527 aa  1093    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  46.61 
 
 
514 aa  493  9.999999999999999e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1460  histone acetyltransferase, ELP3 family  47.45 
 
 
473 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  45.12 
 
 
563 aa  450  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1755  ELP3 family histone acetyltransferase  41.73 
 
 
547 aa  442  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.668163  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  43.44 
 
 
541 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  43.64 
 
 
541 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  42.67 
 
 
541 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  42.12 
 
 
548 aa  437  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50848  predicted protein  42.36 
 
 
544 aa  429  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0872  histone acetyltransferase, ELP3 family  39.12 
 
 
556 aa  425  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2192  histone acetyltransferase, ELP3 family  39.53 
 
 
576 aa  426  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  42.12 
 
 
541 aa  425  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2706  histone acetyltransferase, ELP3 family  38.57 
 
 
553 aa  419  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27329  predicted protein  42.43 
 
 
555 aa  421  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072078  hitchhiker  0.00552121 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00950  Pol II transcription elongation factor, putative  43.94 
 
 
557 aa  414  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1133  ELP3 family histone acetyltransferase  41.18 
 
 
522 aa  412  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42410  predicted protein  41.71 
 
 
558 aa  413  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  42.62 
 
 
510 aa  409  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2930  histone acetyltransferase, ELP3 family  39.19 
 
 
554 aa  410  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  39.61 
 
 
512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  40.11 
 
 
526 aa  404  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1480  histone acetyltransferase, ELP3 family  38.06 
 
 
585 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.761791  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2046  ELP3 family histone acetyltransferase  39.61 
 
 
530 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02294  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06140)  40.67 
 
 
574 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0612  ELP3 family histone acetyltransferase  43.97 
 
 
459 aa  395  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0586  ELP3 family histone acetyltransferase  43.72 
 
 
459 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000912711  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  41.81 
 
 
477 aa  392  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  41.08 
 
 
483 aa  388  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  41.81 
 
 
469 aa  385  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_551  radical SAM superfamily  42.18 
 
 
459 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0398241  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1956  ELP3 family histone acetyltransferase  41.6 
 
 
526 aa  385  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1304  hypothetical protein  39.56 
 
 
520 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08040  histone acetyltransferase  34.69 
 
 
598 aa  204  4e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.584733  hitchhiker  0.0000000843356 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0906  Histone acetyltransferase  32.21 
 
 
617 aa  198  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.301086  normal  0.526584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  33.43 
 
 
666 aa  188  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  26.03 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1061  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 
343 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8315700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0688  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 
336 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 
351 aa  103  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3202  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 
342 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00235958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
341 aa  101  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 
341 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  23.28 
 
 
345 aa  98.6  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1689  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
357 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  29.22 
 
 
362 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  27 
 
 
374 aa  96.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1971  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 
357 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 
354 aa  94.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 
352 aa  94  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0930  radical SAM family protein  27.6 
 
 
338 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000118017  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2238  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 
354 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 
314 aa  87  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0182  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 
401 aa  86.7  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.534223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.24 
 
 
309 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  31.55 
 
 
334 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0787  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 
317 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0660  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  27.87 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2540  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.093156 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  27.87 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0875  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 
359 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 
317 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1562  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  27.32 
 
 
332 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 
317 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  28.66 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  24.5 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2966  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0294152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  26.04 
 
 
313 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  26.47 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  26.47 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  26.47 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  25.75 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  27.11 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  26.22 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  26.47 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  26.47 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  24.39 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  25.88 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  26.51 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  26.51 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  26.99 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4499  Fe-S oxidoreductase  25.88 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1611  radical SAM superfamily protein  26.19 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.586759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  24.82 
 
 
309 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2223  hypothetical protein  27.33 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  24.73 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  30.83 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  25.25 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  25.88 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  26.62 
 
 
309 aa  67  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  23.89 
 
 
317 aa  67  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  24.36 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4892  hypothetical protein  24.71 
 
 
319 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  25.93 
 
 
351 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  25.97 
 
 
330 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1256  putative radical SAM protein  27.27 
 
 
309 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0785555  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  27.27 
 
 
309 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>