More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3236 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3236  Coproporphyrinogen dehydrogenase  100 
 
 
486 aa  972    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363144  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4104  Coproporphyrinogen dehydrogenase  63.48 
 
 
448 aa  559  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.524988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1173  coproporphyrinogen III oxidase  60.04 
 
 
445 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.75222  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0739  coproporphyrinogen III oxidase  61.78 
 
 
447 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1841  coproporphyrinogen III oxidase  53.32 
 
 
439 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1642  Coproporphyrinogen dehydrogenase  34.27 
 
 
443 aa  290  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4243  coproporphyrinogen III oxidase  36.38 
 
 
413 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4222  coproporphyrinogen III oxidase  36.16 
 
 
413 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30.4 
 
 
388 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4879  Coproporphyrinogen dehydrogenase  30.2 
 
 
460 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  26.98 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  26.86 
 
 
378 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  26.86 
 
 
379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  26.86 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  30.32 
 
 
396 aa  140  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  26.6 
 
 
379 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  26.46 
 
 
379 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  26.98 
 
 
378 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.22 
 
 
380 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  32.89 
 
 
465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  26.33 
 
 
378 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  26.6 
 
 
379 aa  137  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  26.33 
 
 
378 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  26.33 
 
 
379 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.72 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.94 
 
 
381 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.27 
 
 
388 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.08 
 
 
375 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  30.46 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.39 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.2 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  30.11 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.66 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.8 
 
 
380 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  29.48 
 
 
379 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  25.99 
 
 
451 aa  126  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  30 
 
 
469 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.2 
 
 
462 aa  126  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.93 
 
 
462 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  26.33 
 
 
451 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2785  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.69 
 
 
395 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419951  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  29.66 
 
 
460 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  26.83 
 
 
455 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.4 
 
 
372 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.47 
 
 
457 aa  124  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  28.3 
 
 
463 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2002  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.75 
 
 
448 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.55227  normal  0.313368 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 
443 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.43 
 
 
423 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  27.13 
 
 
484 aa  123  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  32.76 
 
 
462 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  26.06 
 
 
451 aa  123  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  30.6 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  25.8 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  25.96 
 
 
465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  32.77 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.53 
 
 
410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  27.08 
 
 
374 aa  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0614  coproporphyrinogen III oxidase  29.13 
 
 
472 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.546946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.77 
 
 
383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0781  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  32.68 
 
 
400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.41975  normal  0.123732 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  26.46 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.76 
 
 
378 aa  120  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4269  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.65 
 
 
401 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  29.08 
 
 
463 aa  120  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1957  coproporphyrinogen III oxidase  28.4 
 
 
454 aa  120  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.45 
 
 
380 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  30.54 
 
 
481 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  28.5 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  27.59 
 
 
485 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1952  coproporphyrinogen III oxidase  27.09 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0253288  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  28.5 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01054  coproporphyrinogen III oxidase  26.83 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.299097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  27.34 
 
 
458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  29.29 
 
 
489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2687  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.3 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000667437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  27.89 
 
 
500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  24.04 
 
 
453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  29.38 
 
 
457 aa  118  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  29.38 
 
 
457 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.38 
 
 
457 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  32.09 
 
 
376 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  29.38 
 
 
457 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  29.38 
 
 
457 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.19 
 
 
393 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  33.23 
 
 
409 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  29.38 
 
 
457 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  29.38 
 
 
457 aa  118  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.49 
 
 
389 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  29.38 
 
 
457 aa  118  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  29.67 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  30.54 
 
 
481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  29.95 
 
 
456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4462  coproporphyrinogen III oxidase  25.3 
 
 
435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  26.18 
 
 
472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  30.54 
 
 
481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  30.54 
 
 
483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  28.26 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  28.26 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  28.26 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>