More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1957 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1957  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 454 aa  957    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2542  coproporphyrinogen III oxidase  65.2 
 
 		 454 aa  651    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.846593  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3571  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  59.65 
 
 		 460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.71012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0687  coproporphyrinogen III oxidase  56.42 
 
 		 452 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5318  coproporphyrinogen III oxidase  53.41 
 
 		 454 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.05938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1144  coproporphyrinogen III oxidase  55.07 
 
 		 459 aa  511  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1952  coproporphyrinogen III oxidase  50.77 
 
 		 473 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0253288  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1579  coproporphyrinogen III oxidase  50.11 
 
 		 474 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00577188 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0658  coproporphyrinogen III oxidase  50.55 
 
 		 473 aa  491  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0740  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0285  coproporphyrinogen III oxidase  48.34 
 
 		 475 aa  486  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0598  coproporphyrinogen III oxidase  49.23 
 
 		 475 aa  486  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2490  coproporphyrinogen III oxidase  50.45 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0219656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0614  coproporphyrinogen III oxidase  49.01 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.546946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  38.2 
 
 		 465 aa  326  5e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  38.58 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  37.89 
 
 		 483 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  37.89 
 
 		 483 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  37.89 
 
 		 481 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  37.89 
 
 		 483 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 		 460 aa  317  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  37.89 
 
 		 481 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  37.89 
 
 		 483 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  37.89 
 
 		 483 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  37.8 
 
 		 451 aa  315  9e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  36.94 
 
 		 494 aa  315  9e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.62 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  38.48 
 
 		 462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  38.24 
 
 		 451 aa  313  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  37.36 
 
 		 487 aa  312  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 		 465 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  36.74 
 
 		 456 aa  312  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  37.3 
 
 		 481 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  36.71 
 
 		 494 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  38.02 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  38.24 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  36.87 
 
 		 453 aa  309  5e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 		 460 aa  309  6.999999999999999e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.47 
 
 		 462 aa  309  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  38.24 
 
 		 473 aa  308  9e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  36.85 
 
 		 468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  37.53 
 
 		 476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  36.71 
 
 		 510 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 		 455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.82 
 
 		 457 aa  305  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  37.53 
 
 		 460 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  37.53 
 
 		 460 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.72 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  35.83 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.12 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  39.2 
 
 		 458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.51 
 
 		 470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.47 
 
 		 456 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  35.49 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.15 
 
 		 456 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  36.8 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  35.81 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  38.75 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  38.84 
 
 		 446 aa  300  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  35.14 
 
 		 454 aa  299  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.98 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  35.28 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0090  coproporphyrinogen III oxidase  38.84 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  36.88 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  38.31 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  37.44 
 
 		 463 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  38.53 
 
 		 446 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  38.53 
 
 		 446 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  38.53 
 
 		 446 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  38.17 
 
 		 446 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 		 463 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.7 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0053  coproporphyrinogen III oxidase  39.06 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59946  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0096  coproporphyrinogen III oxidase  38.17 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.79 
 
 		 465 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  35.6 
 
 		 463 aa  296  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  36.47 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  36.57 
 
 		 489 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  36.36 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  38.74 
 
 		 446 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 446 aa  295  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.32 
 
 		 461 aa  293  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  36.81 
 
 		 452 aa  293  5e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.06 
 
 		 464 aa  293  6e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  37.22 
 
 		 485 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  37.22 
 
 		 457 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.69 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  37.22 
 
 		 457 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  37.22 
 
 		 457 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  37.22 
 
 		 457 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.69 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01054  coproporphyrinogen III oxidase  35.81 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.299097  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  33.86 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  36.02 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4161  coproporphyrinogen III oxidase  36.69 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0332782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>