More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4879 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4879  Coproporphyrinogen dehydrogenase  100 
 
 
460 aa  912    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4222  coproporphyrinogen III oxidase  28.47 
 
 
413 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4243  coproporphyrinogen III oxidase  28.31 
 
 
413 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4104  Coproporphyrinogen dehydrogenase  33.41 
 
 
448 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.524988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  26.1 
 
 
375 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.97 
 
 
381 aa  150  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0739  coproporphyrinogen III oxidase  34.39 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.98 
 
 
389 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  36.2 
 
 
385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  28.99 
 
 
391 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  31.83 
 
 
378 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.87 
 
 
380 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1642  Coproporphyrinogen dehydrogenase  25.73 
 
 
443 aa  144  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1173  coproporphyrinogen III oxidase  29.96 
 
 
445 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.75222  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  32.18 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5151  coproporphyrinogen III oxidase  29.61 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.294445  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2322  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.31 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0322  coproporphyrinogen III oxidase  29.36 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5101  coproporphyrinogen III oxidase  29.26 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608313  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  32.18 
 
 
380 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  31.49 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02748  hypothetical protein  31.49 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3278  coproporphyrinogen III oxidase  33.21 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.026335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0755  coproporphyrinogen III oxidase  31.83 
 
 
379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.14 
 
 
381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3267  coproporphyrinogen III oxidase  32.85 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  29.53 
 
 
376 aa  140  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  31.91 
 
 
380 aa  140  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4258  coproporphyrinogen III oxidase  31.14 
 
 
378 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  32.57 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  31.02 
 
 
379 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3097  coproporphyrinogen III oxidase  31.99 
 
 
378 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345052 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.14 
 
 
378 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0826  coproporphyrinogen III oxidase  30.46 
 
 
376 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3447  coproporphyrinogen III oxidase  32.85 
 
 
378 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.286445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3115  coproporphyrinogen III oxidase  31.14 
 
 
378 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3343  coproporphyrinogen III oxidase  32.85 
 
 
378 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0143  coproporphyrinogen III oxidase  30.46 
 
 
376 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483536 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0759  coproporphyrinogen III oxidase  31.14 
 
 
378 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573813 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0825  coproporphyrinogen III oxidase  30.46 
 
 
376 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.330416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  31.92 
 
 
384 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  31.14 
 
 
378 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.93 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3299  coproporphyrinogen III oxidase  30.8 
 
 
378 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3351  coproporphyrinogen III oxidase  32.48 
 
 
378 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.315269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  32.51 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  23.38 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  28.2 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  31.27 
 
 
384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1841  coproporphyrinogen III oxidase  27.93 
 
 
439 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.57 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  28.64 
 
 
465 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.87 
 
 
378 aa  133  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.69 
 
 
381 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  30.05 
 
 
379 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3236  Coproporphyrinogen dehydrogenase  30.2 
 
 
486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363144  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.19 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1442  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.52 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000616139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  24.29 
 
 
377 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.29 
 
 
380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.79 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.92 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  30.25 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0479  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.67 
 
 
385 aa  130  7.000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0040  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.65 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  28.5 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1636  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.62 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.234243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.43 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  30.82 
 
 
386 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.6 
 
 
382 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03000  coproporphyrinogen III oxidase  30.11 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.49 
 
 
376 aa  127  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  30.11 
 
 
431 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  31.14 
 
 
413 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  30.53 
 
 
404 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  30.08 
 
 
463 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  30.08 
 
 
463 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.04 
 
 
406 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.91 
 
 
432 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.35 
 
 
374 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.33 
 
 
416 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3079  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  31.85 
 
 
380 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.862444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.52 
 
 
382 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0124  coproporphyrinogen III oxidase  29.31 
 
 
392 aa  124  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.63 
 
 
374 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0760  coproporphyrinogen III oxidase  30.09 
 
 
383 aa  123  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  26.7 
 
 
457 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  26.7 
 
 
457 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  26.7 
 
 
457 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  26.7 
 
 
457 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  27.76 
 
 
390 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0835  coproporphyrinogen III oxidase  33.12 
 
 
410 aa  123  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3288  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.52 
 
 
396 aa  123  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.72 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1131  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.26 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230562  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  26.71 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  26.7 
 
 
485 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4323  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.58 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.91 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.4 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>