More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1841 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1841  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
439 aa  902    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3236  Coproporphyrinogen dehydrogenase  53.32 
 
 
486 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363144  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4104  Coproporphyrinogen dehydrogenase  50.8 
 
 
448 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.524988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0739  coproporphyrinogen III oxidase  51.84 
 
 
447 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1173  coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 
445 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.75222  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1642  Coproporphyrinogen dehydrogenase  35.32 
 
 
443 aa  282  8.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4243  coproporphyrinogen III oxidase  37.68 
 
 
413 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4222  coproporphyrinogen III oxidase  37.83 
 
 
413 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30.31 
 
 
388 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.91 
 
 
380 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4879  Coproporphyrinogen dehydrogenase  27.93 
 
 
460 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  23.58 
 
 
380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  37.4 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1554  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.7 
 
 
376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000769723  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.13 
 
 
457 aa  130  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.77 
 
 
375 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  28.41 
 
 
458 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  23.59 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  23.26 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  24.94 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  32.23 
 
 
376 aa  126  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  25.8 
 
 
453 aa  125  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.54 
 
 
389 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0124  coproporphyrinogen III oxidase  29.82 
 
 
392 aa  124  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  28.35 
 
 
463 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.9 
 
 
388 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0122  coproporphyrinogen III oxidase  26.43 
 
 
457 aa  123  6e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  26.82 
 
 
378 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  26.39 
 
 
451 aa  123  7e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  27.22 
 
 
453 aa  123  7e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  26.82 
 
 
379 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  26.82 
 
 
378 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.41 
 
 
461 aa  123  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  27.71 
 
 
484 aa  123  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  26.39 
 
 
451 aa  122  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.03 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  26.39 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  26.82 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  26.56 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  27.6 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.01 
 
 
381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  26.76 
 
 
378 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  26.56 
 
 
378 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  25.94 
 
 
458 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.17 
 
 
448 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  25.69 
 
 
458 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  29.35 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.13 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4269  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281837  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2276  hypothetical protein  29.7 
 
 
375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  27.9 
 
 
472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  25.69 
 
 
458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2785  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.26 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419951  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  28.39 
 
 
473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0143  coproporphyrinogen III oxidase  30.91 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483536 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0826  coproporphyrinogen III oxidase  30.91 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0825  coproporphyrinogen III oxidase  30.91 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.330416  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  27.55 
 
 
460 aa  120  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.13 
 
 
462 aa  120  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4462  coproporphyrinogen III oxidase  27.46 
 
 
435 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.33 
 
 
457 aa  119  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  26.56 
 
 
379 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  28.75 
 
 
494 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  31.05 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  27.95 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  27.3 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  28.54 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.93 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.16 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  25.96 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  26.18 
 
 
446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0053  coproporphyrinogen III oxidase  27.32 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59946  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  26.68 
 
 
510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  24.54 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  32.86 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  27.81 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0479  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.38 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  31.05 
 
 
450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  29.86 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  28.61 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  29.45 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  28.25 
 
 
494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  26.3 
 
 
378 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2601  coproporphyrinogen III oxidase  26.48 
 
 
414 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3225  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.03 
 
 
432 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000826969  normal  0.0243619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  27.25 
 
 
379 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.15 
 
 
460 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  27.06 
 
 
446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  27.05 
 
 
446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2866  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.45 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00010545  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  25.19 
 
 
451 aa  117  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  26.18 
 
 
446 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  28.42 
 
 
460 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  27.94 
 
 
379 aa  117  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.42 
 
 
381 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  30.55 
 
 
380 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3505  coproporphyrinogen III oxidase  26.48 
 
 
414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  29.82 
 
 
380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>