More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1199 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 450 aa  938    Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  99.33 
 
 		 450 aa  932    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  61.11 
 
 		 450 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  60.53 
 
 		 451 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  53.57 
 
 		 450 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  55.33 
 
 		 448 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  54.22 
 
 		 450 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  46.17 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  48.53 
 
 		 480 aa  415  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  45.41 
 
 		 469 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  46.64 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  45.72 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.33 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.19 
 
 		 470 aa  408  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  46.95 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  45.02 
 
 		 449 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.92 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  44.64 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  42.73 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.64 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  43.33 
 
 		 463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.44 
 
 		 444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.44 
 
 		 490 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  43.33 
 
 		 482 aa  350  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 		 463 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 		 463 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  44.44 
 
 		 464 aa  348  8e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  44.22 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  44.22 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  42.67 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  44 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  44 
 
 		 464 aa  347  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  44 
 
 		 464 aa  347  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  44 
 
 		 464 aa  347  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  44 
 
 		 464 aa  347  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  42.22 
 
 		 463 aa  346  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.3 
 
 		 458 aa  340  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  43.3 
 
 		 461 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  42.64 
 
 		 461 aa  339  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 		 500 aa  336  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 452 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  41.82 
 
 		 489 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  38.93 
 
 		 452 aa  330  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.72 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  41.54 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  39.96 
 
 		 463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  38.69 
 
 		 452 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  40.83 
 
 		 494 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.37 
 
 		 464 aa  326  6e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  39.49 
 
 		 450 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  40.73 
 
 		 494 aa  325  9e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  39.64 
 
 		 451 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  39.51 
 
 		 460 aa  323  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  41.07 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  40.42 
 
 		 473 aa  321  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.82 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  38.57 
 
 		 450 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  38.84 
 
 		 451 aa  319  7.999999999999999e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  39.51 
 
 		 481 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  39.51 
 
 		 483 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  39.51 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  38.8 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.18 
 
 		 478 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  39.29 
 
 		 481 aa  316  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.27 
 
 		 454 aa  317  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  39.29 
 
 		 483 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  39.29 
 
 		 483 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  39.07 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  39.09 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.67 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  39.07 
 
 		 483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.68 
 
 		 471 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  38 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  41.53 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  39.33 
 
 		 460 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 		 471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2569  coproporphyrinogen III oxidase  40.93 
 
 		 449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.05 
 
 		 462 aa  310  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  38.39 
 
 		 453 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  38.15 
 
 		 465 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  39.25 
 
 		 451 aa  308  9e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  37.39 
 
 		 471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  39.23 
 
 		 480 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  37.69 
 
 		 458 aa  306  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  38.37 
 
 		 463 aa  306  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 484 aa  305  8.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  39.59 
 
 		 460 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  39.59 
 
 		 460 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.55 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  36.43 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  37.19 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.94 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  39.64 
 
 		 462 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  37.14 
 
 		 451 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  37.92 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>