More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3872 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 470 aa  953    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.8 
 
 		 490 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.22 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.01 
 
 		 456 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  47.95 
 
 		 450 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  47.76 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  47.42 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  45.18 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  45.19 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  45.19 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  46.33 
 
 		 449 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  47.19 
 
 		 451 aa  398  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  45.87 
 
 		 449 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  47.87 
 
 		 450 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  43.43 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  45.74 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.64 
 
 		 444 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  45.96 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  42.96 
 
 		 452 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  42.26 
 
 		 452 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  42.73 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.2 
 
 		 451 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 462 aa  352  8e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.18 
 
 		 454 aa  348  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.63 
 
 		 458 aa  346  6e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  41.72 
 
 		 451 aa  343  5.999999999999999e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  43.13 
 
 		 489 aa  339  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.4 
 
 		 460 aa  338  9e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.14 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.97 
 
 		 478 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.69 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  36.54 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  41.3 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  40.71 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  39.37 
 
 		 472 aa  333  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  40.47 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  41.99 
 
 		 500 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 		 465 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.17 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.17 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 450 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  38.93 
 
 		 450 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  41.81 
 
 		 464 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  41.81 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  41.81 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  35.67 
 
 		 451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  41.59 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  41.59 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.91 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  41.59 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  41.59 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  41.37 
 
 		 463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  35.68 
 
 		 451 aa  319  6e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  38.69 
 
 		 450 aa  319  6e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  41.15 
 
 		 464 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  35.43 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  40.88 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  40.49 
 
 		 482 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  40.27 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  38.93 
 
 		 458 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  40.71 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  40.71 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  35.67 
 
 		 451 aa  317  4e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  39.2 
 
 		 458 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  38.93 
 
 		 458 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.4 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  40.49 
 
 		 461 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  36.16 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 481 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  34.56 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 483 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 483 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  35.21 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  38.32 
 
 		 481 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  40.04 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  38.48 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2569  coproporphyrinogen III oxidase  43.4 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  40.04 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 		 483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 		 483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  36.16 
 
 		 453 aa  309  6.999999999999999e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  36.26 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  39.6 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  37.84 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  39.39 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  39.1 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  36.32 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.99 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  37.69 
 
 		 473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  38.96 
 
 		 460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  39.51 
 
 		 510 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  38.02 
 
 		 458 aa  306  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>