More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1851 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 451 aa  917    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  67.18 
 
 		 451 aa  610  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  61.4 
 
 		 450 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  60.8 
 
 		 450 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  60.8 
 
 		 450 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  63.05 
 
 		 453 aa  548  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  50.55 
 
 		 452 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  50.78 
 
 		 452 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  50.55 
 
 		 452 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3859  coproporphyrinogen III oxidase  51.47 
 
 		 442 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  46.55 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.5 
 
 		 467 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.14 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  44.67 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.5 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  42.54 
 
 		 449 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  42.4 
 
 		 469 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  40.87 
 
 		 450 aa  359  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  43.67 
 
 		 450 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.72 
 
 		 470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  43.18 
 
 		 450 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  43.48 
 
 		 448 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  41.23 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.66 
 
 		 456 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  41.2 
 
 		 451 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 		 480 aa  338  9e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  39.28 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  39.64 
 
 		 450 aa  331  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  39.64 
 
 		 450 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 444 aa  328  8e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 444 aa  325  7e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  41.1 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  40.87 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.74 
 
 		 454 aa  318  9e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.65 
 
 		 490 aa  315  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  35.53 
 
 		 451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  41.15 
 
 		 510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  35.06 
 
 		 451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 		 451 aa  306  6e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  35.06 
 
 		 451 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.67 
 
 		 456 aa  302  8.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  38.93 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  38.93 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4514  coproporphyrinogen III oxidase  37.24 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130289  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4224  coproporphyrinogen III oxidase  37.85 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.365232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.41 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  36.97 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  36.97 
 
 		 483 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  36.97 
 
 		 481 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  36.97 
 
 		 483 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  35.47 
 
 		 484 aa  296  5e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  36.97 
 
 		 483 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  36.97 
 
 		 483 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  38.07 
 
 		 481 aa  296  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  36.97 
 
 		 483 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  37.39 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  37.15 
 
 		 457 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.15 
 
 		 457 aa  295  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  38.76 
 
 		 465 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  37.15 
 
 		 457 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  37.15 
 
 		 457 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  37.15 
 
 		 457 aa  295  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  37.44 
 
 		 458 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  37.15 
 
 		 457 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  37.15 
 
 		 457 aa  295  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  37.15 
 
 		 457 aa  295  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  36.7 
 
 		 473 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  38.94 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  37.22 
 
 		 458 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 		 458 aa  293  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.79 
 
 		 478 aa  292  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  36.92 
 
 		 457 aa  292  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 		 446 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 		 464 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  37.19 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.08 
 
 		 468 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  37.1 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  37.1 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  37.39 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  36.94 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  37.73 
 
 		 487 aa  291  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  37.1 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  39.04 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 464 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 464 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 464 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 464 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  35.17 
 
 		 453 aa  290  4e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  36.87 
 
 		 446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  35.83 
 
 		 453 aa  289  6e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  35.4 
 
 		 453 aa  289  7e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.02 
 
 		 457 aa  289  7e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  36.87 
 
 		 446 aa  289  7e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  36.88 
 
 		 471 aa  289  8e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  37.53 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>