More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0659 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 453 aa  923    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  63.72 
 
 		 451 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  63.05 
 
 		 451 aa  551  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  58.78 
 
 		 450 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  58.78 
 
 		 450 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  58.69 
 
 		 450 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3859  coproporphyrinogen III oxidase  53.65 
 
 		 442 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  52.2 
 
 		 452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  51.98 
 
 		 452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  51.1 
 
 		 452 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  44.35 
 
 		 450 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.87 
 
 		 467 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.19 
 
 		 451 aa  364  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  44.62 
 
 		 454 aa  361  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  42.82 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  41.95 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  43.99 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 		 480 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.49 
 
 		 490 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.3 
 
 		 470 aa  336  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  43.46 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.67 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  40.67 
 
 		 449 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.9 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  39.41 
 
 		 449 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 		 449 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  41.59 
 
 		 450 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  39.32 
 
 		 451 aa  318  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 		 444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  37.81 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  38.41 
 
 		 458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 		 450 aa  309  6.999999999999999e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  38.19 
 
 		 458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  39.21 
 
 		 455 aa  307  3e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  37.97 
 
 		 458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.88 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  39.5 
 
 		 457 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  39.26 
 
 		 461 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0096  coproporphyrinogen III oxidase  37.06 
 
 		 446 aa  293  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0090  coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 		 446 aa  292  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142789 
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  38.8 
 
 		 444 aa  292  8e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  39.34 
 
 		 446 aa  292  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  38.19 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  39.59 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0053  coproporphyrinogen III oxidase  36.74 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59946  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  38.91 
 
 		 481 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  38.91 
 
 		 483 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  39.62 
 
 		 446 aa  289  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.47 
 
 		 462 aa  288  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4224  coproporphyrinogen III oxidase  38.25 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.365232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  39.14 
 
 		 483 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  38.52 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.52 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  38.52 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  38.52 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  38.91 
 
 		 481 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  38.52 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  38.91 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  38.52 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  38.52 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  33.8 
 
 		 451 aa  287  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  38.91 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  38.3 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  34.51 
 
 		 451 aa  288  2e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  38.52 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  38.95 
 
 		 487 aa  287  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  35.35 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 465 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  39.14 
 
 		 483 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4514  coproporphyrinogen III oxidase  38.93 
 
 		 457 aa  286  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130289  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 		 446 aa  286  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.15 
 
 		 457 aa  285  8e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  36.89 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  35.62 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  36.3 
 
 		 458 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  37.22 
 
 		 469 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 		 446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  34.8 
 
 		 453 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  38.15 
 
 		 494 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  37.92 
 
 		 494 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  36.92 
 
 		 468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  38.05 
 
 		 457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  35.06 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  36.07 
 
 		 446 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  36.07 
 
 		 446 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.85 
 
 		 471 aa  283  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  36.07 
 
 		 446 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  36.36 
 
 		 446 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 		 446 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  38.57 
 
 		 457 aa  282  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  37.36 
 
 		 460 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  38.57 
 
 		 457 aa  282  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  38.57 
 
 		 457 aa  282  7.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0687  coproporphyrinogen III oxidase  35.09 
 
 		 452 aa  282  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  36.18 
 
 		 463 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1104  coproporphyrinogen III oxidase  37.84 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 		 460 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>