More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3859 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3859  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 442 aa  889    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  51.58 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  53.65 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  50.91 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  50.68 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  50.45 
 
 		 450 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  51.47 
 
 		 451 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  45.52 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  46.56 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  45.29 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  44.2 
 
 		 450 aa  338  8e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.33 
 
 		 451 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  44.5 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.91 
 
 		 467 aa  325  7e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 449 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  40.32 
 
 		 450 aa  316  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  39.77 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  38.93 
 
 		 451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  39.16 
 
 		 449 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  38.69 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  39.67 
 
 		 454 aa  310  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.57 
 
 		 456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  38.7 
 
 		 449 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.25 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  37.85 
 
 		 450 aa  302  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.56 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 469 aa  294  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  38.97 
 
 		 480 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  35.47 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.55 
 
 		 490 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  35.24 
 
 		 450 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  36.7 
 
 		 444 aa  279  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  38.2 
 
 		 494 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.69 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  36.09 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  36.09 
 
 		 444 aa  276  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  37.93 
 
 		 494 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  36.55 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.38 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  36.45 
 
 		 480 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  36.32 
 
 		 457 aa  272  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  36.41 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  37.6 
 
 		 463 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  35.93 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  38.07 
 
 		 456 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4514  coproporphyrinogen III oxidase  36.71 
 
 		 457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130289  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  37.01 
 
 		 489 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  35.7 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  35.7 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  35.7 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4224  coproporphyrinogen III oxidase  36.47 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.365232  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  36.45 
 
 		 485 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  35.94 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  35.94 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  35.94 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  34.99 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  35.96 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  35.28 
 
 		 458 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  35.51 
 
 		 500 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  32.94 
 
 		 455 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  33.1 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  34.25 
 
 		 463 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  35.05 
 
 		 458 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  34.81 
 
 		 458 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  32.16 
 
 		 451 aa  262  8.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  31.92 
 
 		 453 aa  262  8.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 		 457 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  36.62 
 
 		 457 aa  262  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  32.47 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  35.23 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  32.55 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  33.56 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0614  coproporphyrinogen III oxidase  33.72 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.546946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  35.28 
 
 		 460 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  34.81 
 
 		 460 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  37.23 
 
 		 446 aa  259  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.48 
 
 		 461 aa  259  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  34.35 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  33.88 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  34.35 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  34.11 
 
 		 460 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1104  coproporphyrinogen III oxidase  34.63 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.88 
 
 		 458 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  32.39 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  32.63 
 
 		 451 aa  257  4e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  36.32 
 
 		 463 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  37.59 
 
 		 463 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  37.59 
 
 		 463 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.94 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  34.3 
 
 		 481 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  32.87 
 
 		 484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4161  coproporphyrinogen III oxidase  38.11 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0332782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>