More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1862 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 449 aa  932    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  89.09 
 
 		 449 aa  840    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  78.4 
 
 		 449 aa  744    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  87.75 
 
 		 449 aa  844    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  62.58 
 
 		 480 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  61.57 
 
 		 454 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.79 
 
 		 467 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  47.63 
 
 		 451 aa  425  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  46.61 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  48.42 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  45.72 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  46.45 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  45.72 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.87 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  47.85 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.59 
 
 		 451 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  44.84 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  45.7 
 
 		 450 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  45.74 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  45.52 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.97 
 
 		 490 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  46.26 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.63 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  41.48 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  41.48 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  41.48 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  41.26 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  41.26 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  41.26 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.5 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  41.03 
 
 		 481 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.21 
 
 		 458 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  42.82 
 
 		 462 aa  362  6e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  41.67 
 
 		 481 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  40.88 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.32 
 
 		 444 aa  359  7e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  40.55 
 
 		 453 aa  359  7e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  41.03 
 
 		 463 aa  359  7e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 453 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.94 
 
 		 471 aa  355  7.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  40.98 
 
 		 452 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  39.68 
 
 		 451 aa  355  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  41.22 
 
 		 452 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.41 
 
 		 478 aa  354  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  39.68 
 
 		 451 aa  351  1e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  40.98 
 
 		 452 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  39.91 
 
 		 451 aa  350  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  41.23 
 
 		 451 aa  350  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  42.22 
 
 		 463 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  42.22 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  42.24 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  39.73 
 
 		 455 aa  347  3e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  41.11 
 
 		 465 aa  347  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  42.24 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  43.28 
 
 		 461 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 463 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 463 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  42 
 
 		 482 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  42.01 
 
 		 487 aa  343  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 		 460 aa  343  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  39.04 
 
 		 451 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  39.34 
 
 		 453 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 500 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 469 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  41.78 
 
 		 463 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  41.78 
 
 		 463 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  41.76 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.32 
 
 		 464 aa  340  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  40.27 
 
 		 456 aa  341  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.82 
 
 		 457 aa  340  2e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 		 476 aa  341  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  40.77 
 
 		 468 aa  341  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.67 
 
 		 462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  40.77 
 
 		 470 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  41.53 
 
 		 458 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.46 
 
 		 454 aa  338  8e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.43 
 
 		 465 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  40.96 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  40.96 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.02 
 
 		 468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  41.53 
 
 		 458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  39.03 
 
 		 450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  40.04 
 
 		 489 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 465 aa  335  7e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 465 aa  335  7e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  37.95 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  41.78 
 
 		 460 aa  333  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  41.18 
 
 		 464 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  41.18 
 
 		 464 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  41.11 
 
 		 453 aa  333  5e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  41.18 
 
 		 464 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  41.18 
 
 		 464 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  40.77 
 
 		 469 aa  332  9e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  40.97 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  37.84 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>