More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1485 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  87.75 
 
 		 449 aa  832    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  93.54 
 
 		 449 aa  869    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  79.06 
 
 		 449 aa  743    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 449 aa  931    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  61.92 
 
 		 480 aa  569  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  60.9 
 
 		 454 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  48.53 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  47.06 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.13 
 
 		 467 aa  428  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  46.17 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  48.44 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  47.96 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  46.17 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  45.77 
 
 		 469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.18 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.07 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  44.27 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  44.84 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  44.39 
 
 		 444 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.1 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.36 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  44.62 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  45.8 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 		 452 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  41.45 
 
 		 452 aa  362  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.31 
 
 		 457 aa  361  1e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  41.22 
 
 		 452 aa  359  7e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.43 
 
 		 444 aa  354  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  40.13 
 
 		 483 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  40.13 
 
 		 483 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  40.13 
 
 		 481 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  39.91 
 
 		 483 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  39.91 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  39.91 
 
 		 483 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  40.77 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  40.36 
 
 		 451 aa  349  6e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  40.79 
 
 		 463 aa  349  7e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  39.69 
 
 		 481 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 		 481 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  42.14 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.84 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 453 aa  342  7e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.75 
 
 		 478 aa  342  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  40.65 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.65 
 
 		 458 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  41.78 
 
 		 487 aa  341  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 451 aa  340  4e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 451 aa  340  4e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.9 
 
 		 462 aa  338  8e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 		 454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  38.58 
 
 		 451 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  41.5 
 
 		 463 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 456 aa  335  7.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  38.39 
 
 		 455 aa  335  1e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.6 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  41.72 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  41.55 
 
 		 463 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  39.77 
 
 		 500 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  41.78 
 
 		 463 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 470 aa  333  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  41.56 
 
 		 482 aa  333  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  39.09 
 
 		 494 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 		 472 aa  332  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  39.28 
 
 		 451 aa  332  7.000000000000001e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 468 aa  332  8e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  39.55 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 465 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  40.9 
 
 		 470 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  41.08 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.79 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.32 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.32 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  41.32 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  41.32 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.22 
 
 		 457 aa  330  5.0000000000000004e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.78 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  41.32 
 
 		 460 aa  329  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  38.32 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  41.19 
 
 		 476 aa  327  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 		 465 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 		 465 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  39.42 
 
 		 458 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  40.97 
 
 		 465 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  40.41 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  40.41 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  39.42 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  39.2 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  38.36 
 
 		 468 aa  323  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  41.19 
 
 		 460 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  37.41 
 
 		 452 aa  322  9.000000000000001e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  40.45 
 
 		 463 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  40.88 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  37.84 
 
 		 473 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.52 
 
 		 456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>