More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0435 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  74.44 
 
 		 448 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 450 aa  900    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  60.18 
 
 		 450 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  58.22 
 
 		 450 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  55.43 
 
 		 451 aa  497  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  54.22 
 
 		 450 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  54 
 
 		 450 aa  475  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.78 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  48.98 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  48.44 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.9 
 
 		 467 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  48.99 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  47.85 
 
 		 449 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.87 
 
 		 470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  50.57 
 
 		 480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  47.85 
 
 		 449 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.45 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.66 
 
 		 490 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  45.87 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  47.31 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  46.1 
 
 		 444 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  45.18 
 
 		 444 aa  372  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  45.18 
 
 		 444 aa  372  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  43.98 
 
 		 452 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  43.49 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  43.75 
 
 		 452 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  42.76 
 
 		 452 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  43.67 
 
 		 451 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.92 
 
 		 454 aa  350  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  44.24 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  43.49 
 
 		 456 aa  345  8e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  44.07 
 
 		 461 aa  345  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  43.99 
 
 		 453 aa  345  8.999999999999999e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  44.11 
 
 		 489 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  43.62 
 
 		 461 aa  342  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  43.18 
 
 		 470 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  41.36 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  42.82 
 
 		 500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.55 
 
 		 458 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  41.36 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 		 453 aa  333  3e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  42.6 
 
 		 494 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  43.47 
 
 		 463 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  42.31 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  43.24 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  42 
 
 		 468 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  41.31 
 
 		 480 aa  330  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 		 481 aa  329  6e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 		 483 aa  329  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 		 483 aa  329  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  42.54 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  40.49 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 		 483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  43.05 
 
 		 463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  40.79 
 
 		 460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  39.68 
 
 		 458 aa  327  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  42.69 
 
 		 481 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 		 481 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  42.69 
 
 		 483 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  42.69 
 
 		 483 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 463 aa  327  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0233  coproporphyrinogen III oxidase  41.08 
 
 		 457 aa  325  7e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.891625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.13 
 
 		 462 aa  325  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  40 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  39.34 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  41.57 
 
 		 465 aa  324  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  38.39 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.95 
 
 		 470 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  42.38 
 
 		 463 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  42.38 
 
 		 463 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  41.65 
 
 		 460 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  42.23 
 
 		 460 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  42.23 
 
 		 460 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  41.61 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  42.83 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3859  coproporphyrinogen III oxidase  40.32 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  41.42 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  37.04 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  42.6 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  42.13 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  41.4 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  42.6 
 
 		 464 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  42.6 
 
 		 464 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  42.46 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  41.03 
 
 		 460 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  36.98 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  40.56 
 
 		 460 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  39.17 
 
 		 457 aa  316  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  42.15 
 
 		 464 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  42.15 
 
 		 464 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.38 
 
 		 478 aa  316  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  40.33 
 
 		 460 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  42.15 
 
 		 464 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  42.15 
 
 		 464 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  40.93 
 
 		 458 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4161  coproporphyrinogen III oxidase  40.28 
 
 		 457 aa  315  7e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0332782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  42.26 
 
 		 462 aa  315  9e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>