More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2555 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 451 aa  910    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  45.96 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  46.77 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.8 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  49.09 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  47.33 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  46.59 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.58 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  46.22 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  47.77 
 
 		 454 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  46.36 
 
 		 449 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  46.76 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  48.21 
 
 		 480 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.21 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  46.14 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  46.47 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  45.43 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.71 
 
 		 490 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  43.82 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  48.63 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  45.21 
 
 		 444 aa  365  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  45.33 
 
 		 452 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  45.19 
 
 		 453 aa  362  8e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  45.1 
 
 		 452 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.2 
 
 		 470 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  44.76 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  44.06 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.8 
 
 		 454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  43.64 
 
 		 450 aa  352  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  43.93 
 
 		 450 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  43.18 
 
 		 450 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3859  coproporphyrinogen III oxidase  45.33 
 
 		 442 aa  342  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  42.48 
 
 		 464 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  42.48 
 
 		 464 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  42.48 
 
 		 464 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  41.2 
 
 		 450 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  42.48 
 
 		 464 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  40.97 
 
 		 450 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  41.81 
 
 		 463 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  42.04 
 
 		 464 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  42.04 
 
 		 464 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  42.04 
 
 		 464 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  42.04 
 
 		 464 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  41.59 
 
 		 463 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  42.26 
 
 		 463 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  41.81 
 
 		 463 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.25 
 
 		 478 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  41.81 
 
 		 463 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 		 489 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  42.01 
 
 		 481 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  40.93 
 
 		 463 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 473 aa  328  9e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  38.94 
 
 		 456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  42.01 
 
 		 483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  42.01 
 
 		 483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.11 
 
 		 462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  41.79 
 
 		 483 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  41.79 
 
 		 481 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  41.79 
 
 		 483 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  39.78 
 
 		 465 aa  326  5e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  41.11 
 
 		 487 aa  325  8.000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  41.19 
 
 		 482 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  41.58 
 
 		 483 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.41 
 
 		 458 aa  323  5e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 		 500 aa  322  9.000000000000001e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.82 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  41.38 
 
 		 481 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  40.53 
 
 		 461 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  38.67 
 
 		 457 aa  319  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  41.76 
 
 		 462 aa  318  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  36.5 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 460 aa  316  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 		 456 aa  316  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.43 
 
 		 462 aa  316  6e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  36.41 
 
 		 451 aa  315  7e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  40.58 
 
 		 510 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  39.39 
 
 		 494 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  38.11 
 
 		 463 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  40.4 
 
 		 441 aa  314  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  38.14 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 461 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  35.99 
 
 		 455 aa  312  7.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 		 453 aa  312  9e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  39.17 
 
 		 494 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  35.94 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  35.75 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.77 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  37.69 
 
 		 460 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  35.48 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.02 
 
 		 471 aa  310  5e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4161  coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0332782  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  38.94 
 
 		 470 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  38.12 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  38.12 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  38.12 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  37.89 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  37.27 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>