More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3244 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
480 aa  989    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  61.92 
 
 
449 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  62.81 
 
 
454 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  62.58 
 
 
449 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  63.03 
 
 
449 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  62.58 
 
 
449 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  51.13 
 
 
451 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.34 
 
 
467 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  49.32 
 
 
450 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  47.52 
 
 
469 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  46.52 
 
 
444 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  48.53 
 
 
450 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  48.53 
 
 
450 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  48.11 
 
 
450 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  50.57 
 
 
450 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.31 
 
 
456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  46.21 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  45.98 
 
 
444 aa  405  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.21 
 
 
451 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  45.92 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.96 
 
 
470 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.81 
 
 
490 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.53 
 
 
444 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  49.32 
 
 
448 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.14 
 
 
454 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  43.31 
 
 
451 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.24 
 
 
457 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.14 
 
 
478 aa  364  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.94 
 
 
462 aa  360  2e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  42.09 
 
 
463 aa  358  9e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.7 
 
 
462 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.41 
 
 
465 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.41 
 
 
465 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.3 
 
 
458 aa  352  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  42.41 
 
 
456 aa  352  7e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  39.58 
 
 
453 aa  349  7e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  44.44 
 
 
463 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  42.56 
 
 
452 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  43.02 
 
 
452 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  43.37 
 
 
463 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  38.71 
 
 
453 aa  346  4e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  40.27 
 
 
481 aa  346  5e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  44.21 
 
 
463 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  38.94 
 
 
452 aa  346  7e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 
452 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 
453 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  43.65 
 
 
482 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  40 
 
 
441 aa  345  2e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  40.93 
 
 
465 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  42.43 
 
 
489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  43.15 
 
 
463 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 
451 aa  343  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  38.57 
 
 
483 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  38.57 
 
 
483 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  38.5 
 
 
455 aa  342  1e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  39.56 
 
 
481 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  38.89 
 
 
453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 
463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 
463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 
483 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 
483 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 
483 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  44.6 
 
 
461 aa  339  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  39.96 
 
 
469 aa  338  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  42.14 
 
 
462 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  42.53 
 
 
476 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  37.88 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  38.57 
 
 
451 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  37.41 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 
464 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.89 
 
 
469 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.48 
 
 
471 aa  336  5.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 
451 aa  336  5.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  39.11 
 
 
481 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  41.74 
 
 
500 aa  335  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  43.3 
 
 
464 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  43.3 
 
 
464 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  43.3 
 
 
464 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  43.3 
 
 
464 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  40.84 
 
 
494 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  43.3 
 
 
464 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  43.3 
 
 
464 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.18 
 
 
470 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  40.14 
 
 
494 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  43.08 
 
 
464 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.3 
 
 
456 aa  333  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  43.08 
 
 
464 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 
471 aa  331  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.56 
 
 
457 aa  332  1e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 
465 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  40.87 
 
 
460 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  40.87 
 
 
460 aa  330  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  38.96 
 
 
463 aa  329  8e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  36.49 
 
 
456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  36.69 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  42.79 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 
463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  36.7 
 
 
460 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 
487 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 
463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>