More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1560 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 444 aa  879    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.55 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.78 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  50.45 
 
 		 450 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  46.98 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  48.87 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.86 
 
 		 456 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.64 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  49.77 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.21 
 
 		 451 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.66 
 
 		 490 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  48.85 
 
 		 454 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  47.53 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  46.55 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  49.65 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  46.5 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  43.43 
 
 		 449 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  45.84 
 
 		 451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  43.88 
 
 		 449 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  44.32 
 
 		 449 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 		 452 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  43.25 
 
 		 450 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  43.44 
 
 		 450 aa  352  8e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  43.74 
 
 		 450 aa  352  8.999999999999999e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  43.88 
 
 		 451 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.32 
 
 		 458 aa  349  5e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  42.38 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  45.13 
 
 		 444 aa  348  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  44.89 
 
 		 444 aa  347  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  42.15 
 
 		 452 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.05 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  42.69 
 
 		 456 aa  344  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.05 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  42.56 
 
 		 450 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  44.67 
 
 		 453 aa  343  5e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 		 458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 		 450 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 		 458 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  43.05 
 
 		 494 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  43.05 
 
 		 494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  41.63 
 
 		 458 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  43.47 
 
 		 444 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  41.23 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  43.67 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  44.17 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  44.17 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  38.84 
 
 		 460 aa  329  7e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  39.01 
 
 		 472 aa  328  9e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  43.89 
 
 		 510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  43.89 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  44.17 
 
 		 463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  41.83 
 
 		 460 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  41.27 
 
 		 465 aa  326  5e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  43.5 
 
 		 463 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.06 
 
 		 465 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  39.45 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  43.67 
 
 		 482 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  40.89 
 
 		 465 aa  322  8e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  42.53 
 
 		 461 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  43.74 
 
 		 489 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  43.05 
 
 		 463 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  40.18 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  44.17 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  44.17 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  44.17 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  44.17 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  44.17 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  44.17 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.89 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  38.32 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  44.17 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 		 471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.26 
 
 		 457 aa  319  7e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 		 469 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  41.35 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  41.39 
 
 		 460 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  37.42 
 
 		 455 aa  316  4e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  39.64 
 
 		 463 aa  316  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 		 470 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.04 
 
 		 457 aa  316  5e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.82 
 
 		 468 aa  316  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  41.39 
 
 		 460 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  41.61 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  42.6 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3859  coproporphyrinogen III oxidase  44.56 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.32 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.54 
 
 		 462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  37.84 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  41.39 
 
 		 460 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  43.27 
 
 		 464 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  40.67 
 
 		 460 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  36.78 
 
 		 451 aa  312  5.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  39.37 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  39.73 
 
 		 457 aa  310  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  41.16 
 
 		 460 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.06 
 
 		 462 aa  310  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4161  coproporphyrinogen III oxidase  39.5 
 
 		 457 aa  309  6.999999999999999e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0332782  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.34 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>