More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0317 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 452 aa  933    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  93.81 
 
 		 452 aa  881    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  99.78 
 
 		 452 aa  930    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  52.77 
 
 		 451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  52.2 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  50.55 
 
 		 451 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  47.29 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  46.76 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  46.83 
 
 		 450 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3859  coproporphyrinogen III oxidase  45.29 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  44.67 
 
 		 450 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.1 
 
 		 451 aa  361  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  44.62 
 
 		 454 aa  360  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  41.22 
 
 		 449 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.73 
 
 		 470 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  42.05 
 
 		 469 aa  355  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.1 
 
 		 467 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.47 
 
 		 490 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  43.75 
 
 		 450 aa  349  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  41.22 
 
 		 449 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  42.39 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  42.99 
 
 		 450 aa  346  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  40.98 
 
 		 449 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  40.14 
 
 		 450 aa  345  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 451 aa  341  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.72 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.15 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  41.26 
 
 		 448 aa  329  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.07 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  39.81 
 
 		 444 aa  322  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  39.81 
 
 		 444 aa  322  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 455 aa  318  9e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  38.69 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  38.52 
 
 		 450 aa  316  5e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.06 
 
 		 462 aa  313  4.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  38.03 
 
 		 451 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  37.81 
 
 		 453 aa  312  7.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.5 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  37.41 
 
 		 453 aa  310  4e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  38.39 
 
 		 489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  38.39 
 
 		 510 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  39.52 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  36.15 
 
 		 451 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  37.56 
 
 		 500 aa  303  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  38.7 
 
 		 483 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  36.15 
 
 		 451 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  38.48 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  38.48 
 
 		 483 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.69 
 
 		 462 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  38.48 
 
 		 483 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  36.94 
 
 		 453 aa  300  3e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 		 481 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  37.9 
 
 		 494 aa  299  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  38.13 
 
 		 494 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.47 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  35.68 
 
 		 451 aa  297  3e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  36.32 
 
 		 460 aa  296  7e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 		 461 aa  295  8e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  38.27 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.95 
 
 		 458 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 		 478 aa  293  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.34 
 
 		 465 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  37.36 
 
 		 468 aa  293  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 		 452 aa  292  7e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  35.89 
 
 		 458 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  36.18 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  36.18 
 
 		 458 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  38.15 
 
 		 487 aa  290  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  36.4 
 
 		 458 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 		 446 aa  289  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  35.93 
 
 		 446 aa  289  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  36.42 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  37.16 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.39 
 
 		 464 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  38.17 
 
 		 464 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  36.7 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  36.7 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  36.7 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  36.7 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  37.95 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  36.38 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  36.9 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  34.63 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>