More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3273 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 448 aa  889    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  74.44 
 
 		 450 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  61.92 
 
 		 450 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  58.76 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  55.75 
 
 		 451 aa  485  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  55.33 
 
 		 450 aa  474  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  55.11 
 
 		 450 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.62 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.12 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 		 470 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  47.83 
 
 		 469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  45.8 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  46.09 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  46.26 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  46.26 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.63 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  49.32 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.65 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  46.26 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  47.25 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.49 
 
 		 490 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  43.48 
 
 		 451 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  42.49 
 
 		 450 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  41.72 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  43.47 
 
 		 441 aa  341  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.03 
 
 		 454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3859  coproporphyrinogen III oxidase  44.5 
 
 		 442 aa  340  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  43.02 
 
 		 444 aa  340  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  41.26 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  41 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  43.46 
 
 		 453 aa  335  7.999999999999999e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  41.88 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.7 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  43.82 
 
 		 444 aa  332  8e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  43.82 
 
 		 444 aa  332  9e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  41.75 
 
 		 450 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  41.57 
 
 		 451 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  44.32 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  43.84 
 
 		 470 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  43.92 
 
 		 463 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  44.93 
 
 		 461 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  43.21 
 
 		 463 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  44.14 
 
 		 463 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  44.24 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  41.61 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  43.21 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  43.21 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  42.76 
 
 		 482 aa  315  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.9 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.24 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 		 481 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 		 483 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  42.33 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 		 483 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 		 481 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  42.73 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 		 483 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  38.8 
 
 		 453 aa  309  8e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  41.84 
 
 		 481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  41.01 
 
 		 465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  41.63 
 
 		 494 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  41.63 
 
 		 494 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.5 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  42.49 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  40.97 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.69 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  38.62 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 		 460 aa  303  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  41.07 
 
 		 510 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  40.28 
 
 		 460 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 		 460 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.4 
 
 		 471 aa  299  6e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2569  coproporphyrinogen III oxidase  41.88 
 
 		 449 aa  299  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  40.59 
 
 		 460 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  42.49 
 
 		 487 aa  298  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  38.93 
 
 		 463 aa  298  9e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  40.23 
 
 		 460 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  39.12 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  40.23 
 
 		 460 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  38.14 
 
 		 463 aa  296  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 		 464 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 		 464 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 		 464 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 		 464 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 		 476 aa  296  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 		 464 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  36.68 
 
 		 451 aa  295  8e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 		 463 aa  295  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 		 463 aa  295  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 		 446 aa  295  8e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  37.07 
 
 		 446 aa  295  8e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  35.75 
 
 		 451 aa  295  9e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  39.91 
 
 		 460 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  35.51 
 
 		 456 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1668  coproporphyrinogen III oxidase  42.96 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>