More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0977 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 452 aa  934    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  93.81 
 
 		 452 aa  881    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  94.03 
 
 		 452 aa  884    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  52.55 
 
 		 451 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  50.55 
 
 		 451 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  51.1 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  48.19 
 
 		 450 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  47.87 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  47.74 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3859  coproporphyrinogen III oxidase  46.56 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  43.57 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.29 
 
 		 467 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 		 449 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  43.58 
 
 		 454 aa  363  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.26 
 
 		 470 aa  359  6e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  41.82 
 
 		 469 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.06 
 
 		 451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.69 
 
 		 490 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  41.22 
 
 		 449 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  40.98 
 
 		 449 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.13 
 
 		 456 aa  348  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  42.76 
 
 		 450 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 		 444 aa  348  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  39.67 
 
 		 450 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  42.52 
 
 		 449 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  42.52 
 
 		 450 aa  346  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  43.02 
 
 		 480 aa  340  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  41.45 
 
 		 444 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  41.72 
 
 		 448 aa  333  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 451 aa  333  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.2 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 		 444 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 450 aa  322  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  39.07 
 
 		 455 aa  322  7e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  37.91 
 
 		 450 aa  320  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  37.88 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  37.18 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  37.81 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  39.45 
 
 		 510 aa  317  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  37.36 
 
 		 453 aa  317  4e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  37.18 
 
 		 451 aa  315  9e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.84 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  39.25 
 
 		 457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  36.71 
 
 		 451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  39.22 
 
 		 494 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.69 
 
 		 458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  39.45 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  38.39 
 
 		 489 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  36.47 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.12 
 
 		 469 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 		 460 aa  301  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  37.12 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1668  coproporphyrinogen III oxidase  39.07 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  36.61 
 
 		 446 aa  298  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.41 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.51 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  36.64 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  38.03 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  38.03 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  37.1 
 
 		 500 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  38.03 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  37.39 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 457 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 		 485 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.24 
 
 		 457 aa  296  6e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  37.81 
 
 		 481 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  37.39 
 
 		 446 aa  295  8e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  37.81 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  36.87 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  35.76 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  37.81 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  39.06 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  39.06 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  37.39 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  37.16 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  37.16 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  38.04 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  35.43 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  37.16 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  38.93 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  37.16 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  37.39 
 
 		 446 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  36.32 
 
 		 472 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  38.7 
 
 		 463 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>