More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0687 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0687  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 452 aa  950    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1957  coproporphyrinogen III oxidase  56.42 
 
 		 454 aa  561  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2490  coproporphyrinogen III oxidase  58.84 
 
 		 454 aa  556  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0219656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2542  coproporphyrinogen III oxidase  54.87 
 
 		 454 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.846593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5318  coproporphyrinogen III oxidase  55.43 
 
 		 454 aa  542  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.05938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1144  coproporphyrinogen III oxidase  56.54 
 
 		 459 aa  538  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3571  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.51 
 
 		 460 aa  515  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.71012 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0598  coproporphyrinogen III oxidase  52.13 
 
 		 475 aa  508  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1952  coproporphyrinogen III oxidase  51.9 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0253288  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1579  coproporphyrinogen III oxidase  51.12 
 
 		 474 aa  502  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00577188 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0614  coproporphyrinogen III oxidase  52.05 
 
 		 472 aa  501  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.546946  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0658  coproporphyrinogen III oxidase  51.45 
 
 		 473 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0740  coproporphyrinogen III oxidase  52.05 
 
 		 472 aa  500  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0285  coproporphyrinogen III oxidase  51.72 
 
 		 475 aa  497  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.04 
 
 		 462 aa  342  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.18 
 
 		 478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  40.45 
 
 		 468 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  39.73 
 
 		 476 aa  333  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 460 aa  333  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  40.63 
 
 		 462 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.87 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 465 aa  330  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  39.47 
 
 		 473 aa  326  5e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  38.73 
 
 		 465 aa  326  5e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  38.86 
 
 		 460 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 		 454 aa  325  9e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 		 487 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 		 481 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  39.33 
 
 		 482 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  39.87 
 
 		 461 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 		 470 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  39.5 
 
 		 460 aa  322  8e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  39.5 
 
 		 460 aa  322  8e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.34 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  39.28 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.13 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  38.88 
 
 		 463 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  37.73 
 
 		 456 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  39.24 
 
 		 461 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.11 
 
 		 457 aa  316  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  38.65 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  37.16 
 
 		 449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  37.77 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  36.85 
 
 		 468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 		 449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.17 
 
 		 464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 		 480 aa  313  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  35.76 
 
 		 484 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  36.47 
 
 		 449 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  37.83 
 
 		 469 aa  313  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 465 aa  312  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  38.6 
 
 		 463 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  38.72 
 
 		 460 aa  309  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  38.15 
 
 		 463 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  38.15 
 
 		 463 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  37.34 
 
 		 460 aa  309  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  38.69 
 
 		 510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 		 489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.96 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.96 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  38.24 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  38.29 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  36.96 
 
 		 494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.15 
 
 		 471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  38.51 
 
 		 457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  38.07 
 
 		 457 aa  306  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  39 
 
 		 469 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  38.79 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.89 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  37.98 
 
 		 450 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.69 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  37.69 
 
 		 460 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  36.73 
 
 		 494 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  38.12 
 
 		 464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  38.12 
 
 		 464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  38.12 
 
 		 464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  36.87 
 
 		 453 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  37.58 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  37.84 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.2 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  37.36 
 
 		 463 aa  302  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  38.12 
 
 		 464 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  38.12 
 
 		 464 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  38.12 
 
 		 464 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  38.12 
 
 		 464 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>