More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0122 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0122  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 457 aa  947    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.32 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.78 
 
 		 465 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.78 
 
 		 465 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.05 
 
 		 465 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.57 
 
 		 463 aa  348  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.57 
 
 		 463 aa  348  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.92 
 
 		 469 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.78 
 
 		 457 aa  346  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  41.47 
 
 		 472 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  41.76 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  40.54 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  40.4 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  39.35 
 
 		 462 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  39.06 
 
 		 469 aa  335  7e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  39.23 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  40.9 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.13 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  40.36 
 
 		 460 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  41.12 
 
 		 463 aa  333  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.36 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.29 
 
 		 471 aa  331  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 457 aa  330  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 457 aa  329  7e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 457 aa  329  7e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 457 aa  329  7e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  39.86 
 
 		 457 aa  329  7e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 457 aa  329  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 457 aa  329  7e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 457 aa  329  7e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 457 aa  329  7e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.07 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.98 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  40.41 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  39.24 
 
 		 473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  40.18 
 
 		 460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  38.82 
 
 		 460 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 		 458 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  40.6 
 
 		 484 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4161  coproporphyrinogen III oxidase  39.82 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0332782  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 		 458 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 		 494 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.58 
 
 		 457 aa  327  4.0000000000000003e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 457 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 457 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 457 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  40.14 
 
 		 500 aa  325  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  39.05 
 
 		 494 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  38.07 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.3 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  39.69 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  38.85 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  37.77 
 
 		 487 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4224  coproporphyrinogen III oxidase  39.41 
 
 		 457 aa  323  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.365232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  39.15 
 
 		 461 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  39.91 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.17 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  39.51 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  39.46 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.75 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4514  coproporphyrinogen III oxidase  39.19 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  40.41 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  38.88 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  40.85 
 
 		 470 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 		 460 aa  319  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  38.89 
 
 		 460 aa  319  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.01 
 
 		 471 aa  319  7.999999999999999e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  39.11 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.12 
 
 		 471 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  38.89 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  38.89 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  39.91 
 
 		 461 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.75 
 
 		 470 aa  317  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  37.88 
 
 		 460 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  39.24 
 
 		 461 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0233  coproporphyrinogen III oxidase  39.14 
 
 		 457 aa  315  8e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.891625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  39.73 
 
 		 460 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  37.2 
 
 		 465 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  38.7 
 
 		 460 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  36.82 
 
 		 456 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  38.44 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  38.39 
 
 		 451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  40.6 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  38.02 
 
 		 510 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  39.01 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  38.57 
 
 		 451 aa  309  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.17 
 
 		 456 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  36.7 
 
 		 468 aa  309  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  38.11 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 		 463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  38.79 
 
 		 451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0096  coproporphyrinogen III oxidase  38.74 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 		 463 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>