More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1952 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0658  coproporphyrinogen III oxidase  84.32 
 
 		 473 aa  863    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0598  coproporphyrinogen III oxidase  88.54 
 
 		 475 aa  897    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1579  coproporphyrinogen III oxidase  86.2 
 
 		 474 aa  881    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00577188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0285  coproporphyrinogen III oxidase  84.93 
 
 		 475 aa  875    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1952  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 473 aa  997    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0253288  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0740  coproporphyrinogen III oxidase  86.81 
 
 		 472 aa  886    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0614  coproporphyrinogen III oxidase  88.51 
 
 		 472 aa  906    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.546946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0687  coproporphyrinogen III oxidase  51.9 
 
 		 452 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1957  coproporphyrinogen III oxidase  50.77 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2542  coproporphyrinogen III oxidase  47.46 
 
 		 454 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.846593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5318  coproporphyrinogen III oxidase  51.7 
 
 		 454 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.05938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2490  coproporphyrinogen III oxidase  48.34 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0219656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3571  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.01 
 
 		 460 aa  465  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.71012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1144  coproporphyrinogen III oxidase  48.75 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  39.08 
 
 		 460 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  37.34 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  37.75 
 
 		 462 aa  320  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.01 
 
 		 478 aa  320  5e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 		 464 aa  318  9e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  39.46 
 
 		 456 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  37.75 
 
 		 460 aa  317  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  37.75 
 
 		 460 aa  317  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  38.13 
 
 		 484 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  38.02 
 
 		 460 aa  313  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  36.12 
 
 		 465 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  37.13 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  37.56 
 
 		 463 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  37.11 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  35.62 
 
 		 481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  35.62 
 
 		 483 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  35.62 
 
 		 483 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  39.41 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  35.4 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  35.4 
 
 		 483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  35.4 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  35.4 
 
 		 483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  39.41 
 
 		 451 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  38.95 
 
 		 451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  37.42 
 
 		 465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  37.03 
 
 		 463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  37.83 
 
 		 451 aa  303  6.000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  37.73 
 
 		 461 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.2 
 
 		 458 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  34.96 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  36.81 
 
 		 463 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  36.81 
 
 		 463 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.7 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  36.72 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  36.95 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  36.38 
 
 		 453 aa  297  2e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  36.81 
 
 		 463 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  36.09 
 
 		 473 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  36.75 
 
 		 494 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 		 457 aa  296  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  36.12 
 
 		 460 aa  295  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  36.91 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  36.96 
 
 		 453 aa  293  3e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  35.57 
 
 		 465 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  37.64 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  37.11 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  37.64 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  36.59 
 
 		 461 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  38.28 
 
 		 472 aa  292  9e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  36.67 
 
 		 455 aa  292  9e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  37.14 
 
 		 510 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.18 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.18 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  36.96 
 
 		 480 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  35.52 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  36.57 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  37.22 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  36.75 
 
 		 460 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  35.44 
 
 		 449 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 		 494 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  35.79 
 
 		 464 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  35.79 
 
 		 464 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  37.41 
 
 		 457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  35.79 
 
 		 464 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 		 460 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  36.32 
 
 		 460 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  36.3 
 
 		 464 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  36.3 
 
 		 464 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  36.3 
 
 		 464 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  36.3 
 
 		 464 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  35.28 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  35.15 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  36.08 
 
 		 500 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  36.96 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  35.65 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>