More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0285 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0658  coproporphyrinogen III oxidase  84.37 
 
 
473 aa  857    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0598  coproporphyrinogen III oxidase  86.84 
 
 
475 aa  882    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1952  coproporphyrinogen III oxidase  84.93 
 
 
473 aa  875    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0253288  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1579  coproporphyrinogen III oxidase  87.95 
 
 
474 aa  899    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00577188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0285  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
475 aa  1003    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0740  coproporphyrinogen III oxidase  90 
 
 
472 aa  913    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0614  coproporphyrinogen III oxidase  86.6 
 
 
472 aa  880    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.546946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0687  coproporphyrinogen III oxidase  51.72 
 
 
452 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2542  coproporphyrinogen III oxidase  48.41 
 
 
454 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.846593  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1957  coproporphyrinogen III oxidase  48.34 
 
 
454 aa  486  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2490  coproporphyrinogen III oxidase  47.46 
 
 
454 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0219656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5318  coproporphyrinogen III oxidase  49.32 
 
 
454 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.05938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1144  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 
459 aa  455  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3571  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.87 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.71012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  41.5 
 
 
456 aa  333  4e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 
484 aa  329  7e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  37.55 
 
 
460 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  36.82 
 
 
487 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.5 
 
 
458 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.69 
 
 
478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.04 
 
 
462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.78 
 
 
464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  35.82 
 
 
462 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  35.54 
 
 
460 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  35.54 
 
 
460 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  36.12 
 
 
460 aa  312  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  35.57 
 
 
465 aa  309  8e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  35.76 
 
 
468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  36.59 
 
 
476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 
463 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
463 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
463 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  38.06 
 
 
460 aa  306  7e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.75 
 
 
463 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.75 
 
 
463 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 
463 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  36.5 
 
 
473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  33.85 
 
 
481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  33.85 
 
 
483 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  33.85 
 
 
483 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 
482 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  37.84 
 
 
453 aa  301  1e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  35.89 
 
 
464 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  33.63 
 
 
483 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  33.63 
 
 
483 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  33.63 
 
 
483 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  35.89 
 
 
464 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  36.02 
 
 
465 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  35.89 
 
 
464 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  36.75 
 
 
494 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  33.63 
 
 
481 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  36.14 
 
 
461 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.02 
 
 
462 aa  300  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  36.12 
 
 
464 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  36.12 
 
 
464 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  36.12 
 
 
464 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  36.12 
 
 
464 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  33.04 
 
 
481 aa  299  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  36.59 
 
 
470 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  37.19 
 
 
453 aa  298  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  35.52 
 
 
460 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  36.91 
 
 
510 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  36.04 
 
 
465 aa  297  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  35.89 
 
 
464 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  37.05 
 
 
500 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  38.41 
 
 
455 aa  297  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  37.84 
 
 
480 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  34.73 
 
 
449 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 
458 aa  296  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.7 
 
 
457 aa  296  7e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  35.09 
 
 
449 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 
457 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 
457 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  38.18 
 
 
457 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 
457 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 
457 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 
457 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 
494 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 
457 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 
457 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  36.38 
 
 
451 aa  295  2e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  34.58 
 
 
449 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  36.59 
 
 
460 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  36.95 
 
 
457 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 
461 aa  293  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  36.99 
 
 
451 aa  293  6e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  35.7 
 
 
469 aa  292  8e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  36.32 
 
 
461 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 
457 aa  292  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  35.01 
 
 
489 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  37.95 
 
 
457 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  35.45 
 
 
461 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  35.08 
 
 
468 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  36.94 
 
 
457 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  36.51 
 
 
453 aa  290  4e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  36.73 
 
 
451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.83 
 
 
460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  34.37 
 
 
454 aa  289  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>