More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3571 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3571  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 460 aa  966    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.71012 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1957  coproporphyrinogen III oxidase  59.65 
 
 		 454 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2542  coproporphyrinogen III oxidase  56.62 
 
 		 454 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.846593  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0687  coproporphyrinogen III oxidase  53.51 
 
 		 452 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1144  coproporphyrinogen III oxidase  53.64 
 
 		 459 aa  481  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5318  coproporphyrinogen III oxidase  50.65 
 
 		 454 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.05938 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1952  coproporphyrinogen III oxidase  49.01 
 
 		 473 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0253288  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0598  coproporphyrinogen III oxidase  49.01 
 
 		 475 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0614  coproporphyrinogen III oxidase  48.12 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.546946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2490  coproporphyrinogen III oxidase  51.6 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0219656 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1579  coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 		 474 aa  456  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00577188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0285  coproporphyrinogen III oxidase  47.87 
 
 		 475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0658  coproporphyrinogen III oxidase  47.9 
 
 		 473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0740  coproporphyrinogen III oxidase  47.64 
 
 		 472 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  41.72 
 
 		 462 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  39.57 
 
 		 465 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 		 481 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 		 483 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  39.53 
 
 		 483 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  39.53 
 
 		 483 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  39.53 
 
 		 481 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  39.53 
 
 		 483 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  39.53 
 
 		 483 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  40.04 
 
 		 460 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  39.32 
 
 		 481 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  39.6 
 
 		 487 aa  329  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  40.22 
 
 		 468 aa  329  6e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.95 
 
 		 470 aa  318  9e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  39.48 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.16 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 		 476 aa  316  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  38.07 
 
 		 451 aa  316  5e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.67 
 
 		 471 aa  315  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.4 
 
 		 458 aa  315  9e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  38.65 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  38.57 
 
 		 484 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  38.33 
 
 		 460 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  38.33 
 
 		 460 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  40.13 
 
 		 473 aa  312  7.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  39.21 
 
 		 460 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.19 
 
 		 478 aa  310  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 451 aa  309  6.999999999999999e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.45 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  37.92 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.33 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 		 463 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.53 
 
 		 457 aa  306  7e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 		 460 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  37.04 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  39.56 
 
 		 461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 		 453 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 		 453 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.16 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.16 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  37.78 
 
 		 460 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  37.92 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  37.78 
 
 		 460 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  39.02 
 
 		 463 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  37.96 
 
 		 461 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  37.58 
 
 		 460 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  38.58 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  37.58 
 
 		 460 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  37.74 
 
 		 470 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  38.18 
 
 		 461 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  37.77 
 
 		 500 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 		 489 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 		 480 aa  295  9e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  37.8 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  37.34 
 
 		 457 aa  294  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.81 
 
 		 461 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  38.84 
 
 		 464 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  38.84 
 
 		 464 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 		 464 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  39.06 
 
 		 464 aa  292  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  34.2 
 
 		 449 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  39.2 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  39.2 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  37.14 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  39.2 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  38.7 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  38.31 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  39.2 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  36.5 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  34.42 
 
 		 449 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  38.14 
 
 		 463 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  38.14 
 
 		 463 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  37.94 
 
 		 460 aa  290  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  36.48 
 
 		 457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  37.05 
 
 		 463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  36.48 
 
 		 457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  36.48 
 
 		 457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  37.25 
 
 		 463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  37.25 
 
 		 482 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  35.71 
 
 		 494 aa  289  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  36.32 
 
 		 468 aa  289  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  35.78 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>