More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0598 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1952  coproporphyrinogen III oxidase  88.54 
 
 		 473 aa  897    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0253288  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0740  coproporphyrinogen III oxidase  86.17 
 
 		 472 aa  876    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0658  coproporphyrinogen III oxidase  89.15 
 
 		 473 aa  895    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1579  coproporphyrinogen III oxidase  85.77 
 
 		 474 aa  872    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00577188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0285  coproporphyrinogen III oxidase  86.84 
 
 		 475 aa  882    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0598  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 475 aa  1003    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0614  coproporphyrinogen III oxidase  87.58 
 
 		 472 aa  887    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.546946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0687  coproporphyrinogen III oxidase  52.13 
 
 		 452 aa  508  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2542  coproporphyrinogen III oxidase  47.46 
 
 		 454 aa  492  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.846593  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1957  coproporphyrinogen III oxidase  49.23 
 
 		 454 aa  486  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5318  coproporphyrinogen III oxidase  51.02 
 
 		 454 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.05938 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2490  coproporphyrinogen III oxidase  48.12 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0219656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3571  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.01 
 
 		 460 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.71012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1144  coproporphyrinogen III oxidase  48.53 
 
 		 459 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  39.41 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  37.98 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  37.98 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  37.9 
 
 		 484 aa  324  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  37.92 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  40.14 
 
 		 456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.22 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.37 
 
 		 458 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.81 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 		 462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  36.34 
 
 		 465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 		 468 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  35.27 
 
 		 481 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  35.27 
 
 		 483 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  35.27 
 
 		 483 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  35.04 
 
 		 481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  35.04 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  35.04 
 
 		 483 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  35.04 
 
 		 483 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  34.68 
 
 		 481 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  36.44 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  35.62 
 
 		 476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  36.16 
 
 		 449 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  37.92 
 
 		 453 aa  303  6.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  36.73 
 
 		 453 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  35.96 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 		 463 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  36.97 
 
 		 494 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 		 463 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  36.36 
 
 		 482 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.86 
 
 		 470 aa  300  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  36.85 
 
 		 469 aa  299  8e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  38.41 
 
 		 457 aa  299  9e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  36.26 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  36.69 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  38.78 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  38.78 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  36 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  38.27 
 
 		 451 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  35.84 
 
 		 449 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  34.89 
 
 		 449 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  36.83 
 
 		 451 aa  298  2e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  38.13 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  38.5 
 
 		 451 aa  296  4e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  38.27 
 
 		 455 aa  296  6e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  37.13 
 
 		 458 aa  296  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  37.78 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  36.24 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  37.36 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  36.59 
 
 		 470 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  36.3 
 
 		 460 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 		 500 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  36.17 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  38.01 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  38.55 
 
 		 457 aa  295  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  34.39 
 
 		 454 aa  294  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  35.4 
 
 		 449 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  37.19 
 
 		 457 aa  293  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  36.45 
 
 		 446 aa  293  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  37.53 
 
 		 453 aa  293  6e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  34.9 
 
 		 464 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  37.95 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  37.56 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  37.95 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  37.95 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  37.56 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  37.56 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 		 510 aa  292  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  37.95 
 
 		 457 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  35.51 
 
 		 468 aa  292  9e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  36.3 
 
 		 494 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  38.6 
 
 		 460 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.44 
 
 		 457 aa  292  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  35.12 
 
 		 465 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  34.9 
 
 		 464 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.29 
 
 		 457 aa  291  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>