More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1144 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1144  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 459 aa  960    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0687  coproporphyrinogen III oxidase  56.54 
 
 		 452 aa  538  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2490  coproporphyrinogen III oxidase  57.17 
 
 		 454 aa  538  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0219656 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1957  coproporphyrinogen III oxidase  55.07 
 
 		 454 aa  511  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2542  coproporphyrinogen III oxidase  53.56 
 
 		 454 aa  500  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.846593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5318  coproporphyrinogen III oxidase  52.64 
 
 		 454 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.05938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3571  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.64 
 
 		 460 aa  481  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.71012 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0285  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 		 475 aa  455  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0614  coproporphyrinogen III oxidase  49.66 
 
 		 472 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.546946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0740  coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 		 472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1952  coproporphyrinogen III oxidase  48.75 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0253288  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0598  coproporphyrinogen III oxidase  48.53 
 
 		 475 aa  450  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0658  coproporphyrinogen III oxidase  50.11 
 
 		 473 aa  448  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1579  coproporphyrinogen III oxidase  48.98 
 
 		 474 aa  442  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00577188 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  38.41 
 
 		 456 aa  323  5e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  38.31 
 
 		 465 aa  323  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  37.04 
 
 		 460 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  37.63 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 483 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  37.28 
 
 		 483 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  37.28 
 
 		 481 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  36.62 
 
 		 481 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  37.28 
 
 		 483 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  37.28 
 
 		 483 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  37.22 
 
 		 468 aa  305  8.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.86 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  37.23 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.23 
 
 		 478 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  36.18 
 
 		 460 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  35.9 
 
 		 476 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  36.18 
 
 		 460 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.36 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.43 
 
 		 464 aa  300  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  36.96 
 
 		 465 aa  299  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  36.04 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.14 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  35.65 
 
 		 460 aa  296  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 		 482 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.93 
 
 		 462 aa  296  7e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  36.18 
 
 		 460 aa  295  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  35.65 
 
 		 487 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.04 
 
 		 470 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  36.52 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.8 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  36.04 
 
 		 484 aa  294  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  35.18 
 
 		 458 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  35.18 
 
 		 458 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 		 460 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.23 
 
 		 465 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  35.18 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  36.3 
 
 		 468 aa  292  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  38.13 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.74 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  36.23 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.74 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  37.59 
 
 		 463 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  36.58 
 
 		 463 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  35.76 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  36.58 
 
 		 463 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  35.89 
 
 		 451 aa  289  8e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  35.92 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  36.15 
 
 		 463 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  35.08 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  34.85 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  36.11 
 
 		 463 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  35.92 
 
 		 453 aa  286  4e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  35.51 
 
 		 451 aa  286  5.999999999999999e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.95 
 
 		 460 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  35.76 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4161  coproporphyrinogen III oxidase  36.6 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0332782  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  35.76 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  35.11 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  35.9 
 
 		 463 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  35.57 
 
 		 465 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.99 
 
 		 460 aa  283  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  35.9 
 
 		 463 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  35.08 
 
 		 449 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.84 
 
 		 456 aa  282  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 		 469 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  35.6 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.6 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  35.6 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  35.6 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  35.6 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  35.6 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  35.6 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.59 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  35.62 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  35.6 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  36.84 
 
 		 464 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.3 
 
 		 469 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  36.84 
 
 		 464 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  36.52 
 
 		 464 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  34.42 
 
 		 494 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4224  coproporphyrinogen III oxidase  36.17 
 
 		 457 aa  279  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.365232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  35.54 
 
 		 510 aa  279  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  35.34 
 
 		 470 aa  279  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01054  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 		 458 aa  279  9e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.299097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>