176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13790 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 297 aa  619  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  36.71 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  38.77 
 
 		 292 aa  205  8e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  38.23 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  37.76 
 
 		 293 aa  198  9e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  36.07 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  37.41 
 
 		 291 aa  185  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  34.64 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  35.84 
 
 		 293 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  35.34 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  35.02 
 
 		 292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  36.95 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  37.41 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  35.49 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  33.94 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  33.57 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  35.46 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  35.47 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  33.56 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  39.27 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  35.47 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  34.94 
 
 		 293 aa  159  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  35.11 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  34.8 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  31.85 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  35.11 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  36.82 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  35.04 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  34.67 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  37.8 
 
 		 321 aa  152  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  33.21 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  35.05 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.9 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  34.21 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  33.57 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  30.91 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  31.21 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  35.19 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  33.98 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.92 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  29.3 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 380 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 386 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  31.67 
 
 		 390 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 373 aa  92.8  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 377 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  24.2 
 
 		 388 aa  89.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 		 402 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  37.29 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 		 1250 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  22.54 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.77 
 
 		 383 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  24.55 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  24.55 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  24.41 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  28.86 
 
 		 485 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  25.58 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0299  putative coproporphyrinogen III oxidase  36.67 
 
 		 490 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11990  radical SAM protein, TIGR01212 family  24.3 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000013437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  25.34 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  27.93 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  27.93 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 705 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  23.96 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  21.6 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0906  cobalamin B12-binding domain protein  27.41 
 
 		 456 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  22 
 
 		 501 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  27.62 
 
 		 362 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  22.64 
 
 		 314 aa  49.7  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  30.09 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  22.02 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  24.07 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  21.7 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  31.62 
 
 		 321 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2035  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.15 
 
 		 518 aa  49.3  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  21.7 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.29 
 
 		 378 aa  49.3  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  21.7 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  21.7 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  21.7 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0370  putative radical SAM protein  28.57 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 444 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  25.66 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  27.2 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>