123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00660 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 321 aa  659    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  53.51 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  42.4 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  37.8 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  34.9 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  36.86 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  33.48 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  32.76 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.36 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  29.83 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  30.31 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  34.08 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  33.83 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  29.83 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  28.63 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  27.67 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  28.15 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  28.15 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  29.89 
 
 		 293 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  29.43 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  28.15 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  30.54 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  31.49 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  31.47 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  27.76 
 
 		 293 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  34.08 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  31.46 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 291 aa  96.3  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  32.6 
 
 		 298 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  32.6 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.44 
 
 		 257 aa  92.4  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  26.03 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  22.08 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 		 399 aa  79.3  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  31.93 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  22.36 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  22.76 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  23.4 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 1288 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 1250 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1745  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.88 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11650  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.04 
 
 		 411 aa  53.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0627344  normal  0.396756 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.61 
 
 		 385 aa  53.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1379  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.57 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000560145  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.57 
 
 		 466 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1777  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.112435  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  23.51 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  23.67 
 
 		 403 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.67 
 
 		 403 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12400  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.02 
 
 		 426 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00807664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2480  radical SAM domain-containing protein  19.44 
 
 		 453 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.172452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.08 
 
 		 385 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3390  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.35 
 
 		 485 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3411  coproporphyrinogen III oxidase  23.83 
 
 		 401 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0055  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  21.43 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0267  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 469 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  23.71 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3458  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.7 
 
 		 407 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99275  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 441 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3422  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 541 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.32 
 
 		 388 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.23 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  23.71 
 
 		 390 aa  46.2  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 441 aa  45.8  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  27.43 
 
 		 488 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.6 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.33 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2316  radical SAM family protein  26.11 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 533 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.48 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  26.03 
 
 		 409 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  25.49 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.83 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002450  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  23.71 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>