112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1744 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 380 aa  778    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  48.42 
 
 		 386 aa  336  5e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  47.09 
 
 		 388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  43.41 
 
 		 373 aa  299  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  36.48 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  43.35 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  40.68 
 
 		 291 aa  223  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  34.17 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  32.15 
 
 		 296 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  30.13 
 
 		 291 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  29.64 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  29.87 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  28.71 
 
 		 293 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  28.98 
 
 		 292 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  28.16 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  30.7 
 
 		 296 aa  139  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 		 297 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  31.15 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 309 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  27.8 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  30.53 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  29.68 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  28.08 
 
 		 295 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  29.9 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 292 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 293 aa  126  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  29.41 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  28.99 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  27.78 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.25 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  28.42 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  27.22 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  26.3 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 293 aa  104  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.35 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  26.95 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  25.67 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  25.71 
 
 		 293 aa  97.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 390 aa  89.4  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  24.78 
 
 		 300 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  24.65 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  22.69 
 
 		 541 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  25 
 
 		 541 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  25 
 
 		 541 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 156 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  24.79 
 
 		 541 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0579  ELP3 family histone acetyltransferase  20.23 
 
 		 527 aa  53.5  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  25.73 
 
 		 305 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4198  radical SAM domain-containing protein  36.05 
 
 		 620 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 341 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  24.31 
 
 		 307 aa  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 351 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  40.32 
 
 		 473 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0455  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.69 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  40.32 
 
 		 473 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.09 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  31.48 
 
 		 1288 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  24.81 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 		 476 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0952  histone acetyltransferase, ELP3 family  23.78 
 
 		 526 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 460 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.41 
 
 		 476 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2628  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 		 537 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  35.44 
 
 		 475 aa  46.2  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  40.32 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.46 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5458  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.39 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6339  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.79 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7154  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.79 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 732 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3455  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.6 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207743  normal  0.273738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 		 518 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.14 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3764  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.6 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  22.97 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3654  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.6 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176133  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0270  Radical SAM domain protein  23.37 
 
 		 929 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.669686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>