85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1019 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 390 aa  798    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  38.89 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  38.48 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  33.66 
 
 		 338 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  32.79 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  26.69 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  32.79 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  32.24 
 
 		 297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 291 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 		 293 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 300 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  32.06 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  33.01 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  31.1 
 
 		 292 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 		 298 aa  106  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  31.58 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 291 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 294 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  32.39 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  32.18 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  31.61 
 
 		 295 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 		 295 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  27.87 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 		 292 aa  97.8  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 295 aa  96.7  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 293 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 293 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  27.57 
 
 		 293 aa  93.2  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  31.67 
 
 		 297 aa  92.8  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 292 aa  90.9  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 380 aa  89.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 373 aa  89.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 311 aa  89.4  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  25.83 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  26.46 
 
 		 293 aa  87.8  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 		 377 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 399 aa  86.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  29.86 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  26.96 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  28.5 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  23.83 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  22.97 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  31.93 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  26.98 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.61 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  24.03 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.29 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  28.74 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0270  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 929 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.669686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.6 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3233  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 531 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  31.12 
 
 		 502 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000162793  hitchhiker  0.0000142762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1803  radical SAM family protein  25 
 
 		 714 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2480  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.172452  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  24.21 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  25.15 
 
 		 487 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  21.03 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  26.04 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0817  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.2 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00537332  normal  0.704127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17330  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  24.73 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395345  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0352  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3496  hypothetical protein  48.15 
 
 		 38 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.871156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  23.22 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  21.71 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  22.56 
 
 		 533 aa  43.1  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2989  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 500 aa  43.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 459 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>