240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2989 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  65.87 
 
 		 502 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000162793  hitchhiker  0.0000142762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2989  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 500 aa  1018    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  54.49 
 
 		 503 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  62.09 
 
 		 429 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  38.17 
 
 		 531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 716 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 		 732 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 705 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  25.5 
 
 		 715 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1777  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 		 737 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.54513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0105  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 		 636 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 590 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1855  radical SAM family protein  26.13 
 
 		 638 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.357803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 565 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0050  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 707 aa  110  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0070  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 635 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4972  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 738 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4370  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 634 aa  108  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 732 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 632 aa  107  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0089  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 643 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  24.66 
 
 		 644 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3504  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 646 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 642 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  24.33 
 
 		 658 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 658 aa  99.8  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 647 aa  98.2  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0112  Fe-S oxidoreductase  24.83 
 
 		 726 aa  97.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 520 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 502 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2019  Radical SAM domain protein  20.86 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0788272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  23.77 
 
 		 501 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 520 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  25.69 
 
 		 548 aa  72  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 468 aa  69.7  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.39 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3422  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 497 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 576 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1179  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.62 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.846685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  27.55 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 576 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  23.16 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4901  radical SAM family protein  24.75 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  21.68 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3359  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.08 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  24.66 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20660  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  22.49 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.63 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1053  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.27 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1050  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0795903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4283  radical SAM family protein  23.27 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3764  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.56 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2201  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.31 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3408  radical SAM family protein  23 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.35 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3455  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.56 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207743  normal  0.273738 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0968  Radical SAM domain protein  19.57 
 
 		 630 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  23.61 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2133  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.13 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0273985  normal  0.585786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  28.72 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1147  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.76 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125383  normal  0.546782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0692  radical SAM family protein  24.76 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346694  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1171  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  22.65 
 
 		 583 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3654  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  21.8 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176133  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1133  radical SAM family protein  29.09 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  24.18 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  25.85 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1684  radical SAM family protein  27.31 
 
 		 633 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 516 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  22.59 
 
 		 1250 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0973  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  21.8 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.91955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0385  hypothetical protein  22.5 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>