197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4972 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  67.7 
 
 		 732 aa  1066    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1855  radical SAM family protein  48.9 
 
 		 638 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.357803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0070  Radical SAM domain protein  48.74 
 
 		 635 aa  674    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0089  Radical SAM domain protein  50.39 
 
 		 643 aa  662    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4370  radical SAM domain-containing protein  50.08 
 
 		 634 aa  669    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  51.1 
 
 		 658 aa  659    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1777  Radical SAM domain protein  59.14 
 
 		 737 aa  919    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.54513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0112  Fe-S oxidoreductase  52.62 
 
 		 726 aa  783    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  49.84 
 
 		 658 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3504  radical SAM domain-containing protein  50.63 
 
 		 646 aa  656    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0105  radical SAM domain-containing protein  50.08 
 
 		 636 aa  677    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0050  radical SAM domain-containing protein  48.97 
 
 		 707 aa  672    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  49.53 
 
 		 632 aa  652    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4972  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 738 aa  1527    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  60.35 
 
 		 732 aa  947    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  51.1 
 
 		 647 aa  660    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  50.63 
 
 		 644 aa  658    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  50.16 
 
 		 642 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 590 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0533  radical SAM domain protein  57.28 
 
 		 138 aa  132  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  28.41 
 
 		 715 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2989  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  20.75 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  23.55 
 
 		 502 aa  100  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000162793  hitchhiker  0.0000142762 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 531 aa  95.9  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 429 aa  95.9  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 705 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 		 565 aa  90.1  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0968  Radical SAM domain protein  24.27 
 
 		 630 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2379  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 		 623 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2019  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 525 aa  83.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0788272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 716 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  22.08 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  24.23 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2292  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 634 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2894  radical SAM family protein  25.85 
 
 		 613 aa  72  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0316  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.17 
 
 		 567 aa  72  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 529 aa  71.6  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  25.65 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  25.18 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  25.18 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 1288 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  23.05 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  28.64 
 
 		 426 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  22.87 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  22.4 
 
 		 520 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 1250 aa  64.7  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4778  response regulator receiver protein  25.24 
 
 		 675 aa  64.3  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0104454 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  21.57 
 
 		 681 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0942  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.65 
 
 		 528 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  26.12 
 
 		 598 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  22.08 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  23.86 
 
 		 450 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  23.39 
 
 		 864 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2387  cobalamin B12-binding domain protein  23.86 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  22.98 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  21.3 
 
 		 473 aa  62  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1584  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.65 
 
 		 527 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  23.05 
 
 		 552 aa  61.6  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  21.61 
 
 		 502 aa  60.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  28.79 
 
 		 546 aa  59.7  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.908643  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2281  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.21 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  22.67 
 
 		 521 aa  59.3  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  21.6 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  22.61 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2637  putative anaerobic magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester [oxidative] cyclase  23.65 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.27 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0229  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  28.79 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2158  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  27.55 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  20.9 
 
 		 459 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0251  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  28.28 
 
 		 546 aa  57.4  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1976  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  28.28 
 
 		 546 aa  57  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175578  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  20.87 
 
 		 512 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2315  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  27.78 
 
 		 546 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.03087  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2209  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  28.28 
 
 		 546 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.561885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  21.04 
 
 		 723 aa  57.4  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3401  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 484 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 488 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 424 aa  55.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 507 aa  55.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3339  radical SAM domain-containing protein  21.3 
 
 		 555 aa  55.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  20.66 
 
 		 518 aa  55.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.88 
 
 		 476 aa  55.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.76 
 
 		 478 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  22.9 
 
 		 472 aa  54.7  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  21.98 
 
 		 475 aa  54.7  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  25.86 
 
 		 488 aa  54.7  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  21.75 
 
 		 484 aa  54.7  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 		 583 aa  54.3  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 576 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 576 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  22.6 
 
 		 674 aa  54.3  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>