More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0968 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0968  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 630 aa  1286    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2379  Radical SAM domain protein  41.01 
 
 		 623 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4198  radical SAM domain-containing protein  29.42 
 
 		 620 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1133  radical SAM family protein  29.64 
 
 		 656 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1626  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 655 aa  289  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2292  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 634 aa  274  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4968  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 		 652 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1863  radical SAM family protein  33 
 
 		 486 aa  264  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300057  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1684  radical SAM family protein  28.16 
 
 		 633 aa  241  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0095  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 651 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1707  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 		 646 aa  173  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 565 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  27.66 
 
 		 598 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 732 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 471 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.23 
 
 		 472 aa  97.4  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.53 
 
 		 472 aa  97.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.84 
 
 		 681 aa  97.1  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 		 590 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 472 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 473 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.08 
 
 		 674 aa  91.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 518 aa  88.6  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4972  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 738 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  22.67 
 
 		 732 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.12 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  25.83 
 
 		 715 aa  85.5  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  24.51 
 
 		 677 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0316  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  27.38 
 
 		 567 aa  85.1  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1777  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 737 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.54513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 575 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  24.58 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  22.69 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.3 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 		 632 aa  81.3  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  21.7 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0112  Fe-S oxidoreductase  23.06 
 
 		 726 aa  80.9  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1435  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 631 aa  80.5  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0826343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  27.8 
 
 		 554 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.31 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  23.5 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 642 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4778  response regulator receiver protein  26.11 
 
 		 675 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0104454 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  23.5 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  23.72 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  21.45 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1897  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 		 559 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.08 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 		 564 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  23.98 
 
 		 647 aa  77.4  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.65 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.6 
 
 		 512 aa  77  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 		 658 aa  77  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3504  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 646 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 487 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 451 aa  77  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0105  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 636 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  27.49 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10215  methyltransferase  24.75 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  26.56 
 
 		 475 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  22.22 
 
 		 548 aa  75.5  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  26.3 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  27.01 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  21.88 
 
 		 540 aa  75.1  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  21.98 
 
 		 566 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  25 
 
 		 644 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  25.7 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.67 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3186  radical SAM family protein  32.58 
 
 		 583 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.1 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0101  radical SAM family protein  21.88 
 
 		 624 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00410532  normal  0.882418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4064  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25 
 
 		 508 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.416317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 		 507 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.98 
 
 		 609 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1779  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.62 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1616  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 559 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.710753  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2120  radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.323478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 488 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0070  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 635 aa  72  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2158  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  28.41 
 
 		 546 aa  72  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2209  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  28.04 
 
 		 546 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.561885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  22.55 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  21.55 
 
 		 705 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0513  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 609 aa  71.6  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.72 
 
 		 651 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  24.1 
 
 		 501 aa  71.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1976  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  27.12 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175578  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  28.72 
 
 		 647 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>