19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0533 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0533  radical SAM domain protein  100 
 
 		 138 aa  288  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  70.23 
 
 		 632 aa  194  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0070  Radical SAM domain protein  75.44 
 
 		 635 aa  184  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0050  radical SAM domain-containing protein  74.56 
 
 		 707 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4370  radical SAM domain-containing protein  78.64 
 
 		 634 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0105  radical SAM domain-containing protein  65.93 
 
 		 636 aa  181  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0089  Radical SAM domain protein  63.7 
 
 		 643 aa  176  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1855  radical SAM family protein  63.49 
 
 		 638 aa  173  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.357803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  52.52 
 
 		 658 aa  157  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3504  radical SAM domain-containing protein  62.14 
 
 		 646 aa  154  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  61.17 
 
 		 642 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  61.17 
 
 		 644 aa  153  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  61.17 
 
 		 658 aa  152  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  65.05 
 
 		 647 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4972  radical SAM domain-containing protein  57.28 
 
 		 738 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991033  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0112  Fe-S oxidoreductase  58.25 
 
 		 726 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  56.31 
 
 		 732 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1777  Radical SAM domain protein  47.55 
 
 		 737 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.54513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 732 aa  123  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>